Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Adami, Eleonora Dr. (1) Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Beule, Dieter Dr. (1) Birchmeier, Walter Prof. Dr. (3) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (5) Blachut, Susanne (1) Blankenstein, Thomas Prof. Dr. (1) Blume, Alexander Dr. (6) Blüthgen, Nils (1) Borodina, Tatiana Dr. (1) Braeuning, Caroline (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (21) Chen, Wei Prof. Dr. (3) Chu, Van Trung Dr. (22) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Dahlmann, Mathias Dr. (1) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) de la Rosa, Kathrin Dr. (3) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (3) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Farre i Diaz, Carlota (1) Faxel, Miriam (1) Fielitz, Jens Dr. (5) Franke, Vedran Dr. (22) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (2) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (11) Grossmann, Katja Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Heinemann, Udo Prof. Dr. (1) Heuser, Arnd Dr. (1) Hinze, Christian Dr. med. Dipl.-Math. (1) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (4) Hummel, Oliver (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janke, Jürgen Dr. (1) Janz, Martin Dr. (7) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Kabrani, Eleni Dr. (2) Kastelic, Nicolai (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (4) Kirchner, Marieluise Dr. (3) Kocks, Christine Dr. (9) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (11) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Lahmann, Ines Dr. (1) Landthaler, Markus Prof. Dr. (9) Langner, Patrick (1) Lebedin, Mikhail (3) Lewin, Gary Prof. Dr. (1) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Luft, Friedrich Prof. Dr. (2) Lusatis, Simone (1) Mahmoodzadeh, Shokoufeh PD Dr. (1) Marg, Andreas Dr. (2) Mastrobuoni, Guido Dr. (2) Mathas, Stephan Dr. (5) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (4) Monti, Remo (1) Müthel, Stefanie (3) Napieczynska, Hanna Dr. (1) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (2) Pempe, Jenniffer (1) Pischon, Tobias Prof. Dr. (3) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (3) Potente, Michael Prof. Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (81) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (12) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (2) Roske, Yvette Dr. (1) Roßius, Jana (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Ruiz Orera, Jorge Dr. (1) Saar, Kathrin Dr. (1) Salomon, Claudia (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (6) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Schulz-Menger, Jeanette Prof. Dr. (1) Schütz, Anja Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (8) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Sigal, Michael Dr. (1) Sporbert, Anje Dr. (1) Spuler, Simone Prof. (9) Stein, Ulrike Prof. Dr. (1) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Trombke, Janine (2) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Walther, Wolfgang Prof. Dr. (1) Wenzel, Katrin Dr. (1) Willimsky, Gerald Dr. (2) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wolf, Jana Prof. Dr. (1) Wollert-Wulf, Brigitte (1) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (6) Xiong, Ermeng Dr. (2) Zach, Andreas (1) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) Zong, Yue Dr. (1) (-) Herzog, Margareta (1) (-) Hinz, Michael Dr. (3) (-) Kukalev, Alexander Dr. (2) (-) Müller, Thomas Dr. (2) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Animal Phenotyping (1) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (15) Bioinformatik der Genregulation (137) Biologie maligner Lymphome (4) (-) Endokrinologie, Diabetes und Stoffwechselmedizin (1) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (23) Entwicklungsneurobiologie (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (7) Genetik metabolischer und reproduktiver Störungen (3) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (11) (-) Immunregulation und Krebs (2) Klinik für Psychiatrie / Modul Psychiatrie des Alterns (2) Mathematische Modellierung zellulärer Prozesse (1) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Mobile DNA (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (1) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (2) Neuronale Schaltkreise und Verhalten (1) (-) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (1) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (1) Pluripotent Stem Cells (1) Protein Production and Characterization (1) Proteom Dynamik (9) Proteomics (2) Proteomics and Metabolomics (1) Quantitative Entwicklungsbiologie (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (12) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (1) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (11) Systems Biology Imaging (1) Translational Bioinformatics (1) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (2) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (1) Zellzustände und ihre Funktionsweisen (1) 2014 (1) 2015 (2) 2017 (4) 2018 (1) 2019 (3) 2020 (1) 2021 (3) 2022 (3) 18 Ergebnisse: Active Filter: Herzog, MargaretaHinz, Michael Dr.Kukalev, Alexander Dr.Müller, Thomas Dr.Ohler, Uwe Prof. Dr.Bioinformatics and Omics Data ScienceEndokrinologie, Diabetes und StoffwechselmedizinImmunregulation und KrebsNicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller 25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo 13. April 2021 / Cell Rep Parallel genetics of regulatory sequences using scalable genome editing in vivo J.J. Froehlich B. Uyar M. Herzog K. Theil P. Glažar A. Akalin N. Rajewsky 14. Dezember 2018 / EMBO J The IκB kinase complex is a regulator of mRNA stability N. Mikuda M. Kolesnichenko P. Beaudette O. Popp B. Uyar W. Sun A.B. Tufan B. Perder A. Akalin W. Chen P. Mertins G. Dittmar M. Hinz C. Scheidereit 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller
25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo
13. April 2021 / Cell Rep Parallel genetics of regulatory sequences using scalable genome editing in vivo J.J. Froehlich B. Uyar M. Herzog K. Theil P. Glažar A. Akalin N. Rajewsky
14. Dezember 2018 / EMBO J The IκB kinase complex is a regulator of mRNA stability N. Mikuda M. Kolesnichenko P. Beaudette O. Popp B. Uyar W. Sun A.B. Tufan B. Perder A. Akalin W. Chen P. Mertins G. Dittmar M. Hinz C. Scheidereit
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler