Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (22) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mathas, Stephan Dr. (3) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Akalin, Altuna Dr. (73) (-) Herzog, Margareta (1) (-) Kirchner, Marieluise Dr. (1) (-) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) (-) Vucicevic, Dubravka (2) Advanced Light Microscopy (2) AG Schreiber [ECRC] (1) Animal Phenotyping (2) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (73) Bioinformatik der Genregulation (11) Biologie maligner Lymphome (4) Electron Microscopy (1) Endokrinologie, Diabetes und Stoffwechselmedizin (1) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (4) Entwicklung und Funktion neuraler Netzwerke (1) Epigenetische Modifikationen in Neuroblastom (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (91) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (16) Genetik von Angeborenen Herzerkrankungen (1) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (1) Genomdiversifikation & Integrität (3) Genomics (1) Immunregulation und Krebs (2) Integrative Vaskuläre Biologie (1) Mathematische Modellierung zellulärer Prozesse (1) Mathematische Zellphysiologie (3) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (3) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (1) Myologie (3) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (1) Neuroimmunologie-Labor (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (6) Organoids (1) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (1) Pluripotent Stem Cells (3) Proteom Dynamik (17) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (2) Proteomics (34) Proteomics and Metabolomics (2) Psychoneuroimmunologie (1) Quantitative Entwicklungsbiologie (1) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (9) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (4) Synaptische Transmission und Plastitzität (1) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (17) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (1) Translational Bioinformatics (6) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (5) Translationale Tumorimmunologie (2) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (2) Tumorheterogenität und Therapieresistenz in pädiatrischen Tumoren (1) Zelluläre Neurowissenschaften (1) Zellzustände und ihre Funktionsweisen (1) 2006 (2) 2007 (1) 2008 (1) 2009 (3) 2010 (3) 2011 (1) 2012 (4) 2013 (3) 2014 (3) 2015 (3) 2017 (6) 2018 (6) 2019 (9) 2020 (7) 2021 (8) 2022 (6) 2023 (6) 2024 (1) 73 Ergebnisse: Active Filter: Akalin, Altuna Dr.Herzog, MargaretaKirchner, Marieluise Dr.Pombo, Ana Prof. Dr.Vucicevic, DubravkaBioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 01. Dezember 2020 / Ageing Res Rev Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence B. Uyar D. Palmer A. Kowald H.M. Escobar I. Barrantes S. Möller A. Akalin G. Fuellen 11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier 19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler 01. Juli 2020 / Genome Res Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping J.A. Ramilowski C.W. Yip S. Agrawal J.C. Chang Y. Ciani I.V. Kulakovskiy M. Mendez J.L.C. Ooi J.F. Ouyang N. Parkinson A. Petri L. Roos J. Severin K. Yasuzawa I. Abugessaisa A. Akalin I.V. Antonov E. Arner A. Bonetti H. Bono B. Borsari F. Brombacher C.J.F. Cameron C.V. Cannistraci R. Cardenas M. Cardon H. Chang J. Dostie L. Ducoli A. Favorov A. Fort D. Garrido N. Gil J. Gimenez R. Guler L. Handoko J. Harshbarger A. Hasegawa Y. Hasegawa K. Hashimoto N. Hayatsu P. Heutink T. Hirose E.L. Imada M. Itoh B. Kaczkowski A. Kanhere E. Kawabata H. Kawaji T. Kawashima S.T. Kelly M. Kojima N. Kondo H. Koseki T. Kouno A. Kratz M. Kurowska-Stolarska A.T.J. Kwon J. Leek A. Lennartsson M. Lizio F. López-Redondo J. Luginbühl S. Maeda V.J. Makeev L. Marchionni Y.A. Medvedeva A. Minoda F. Müller M. Muñoz-Aguirre M. Murata H. Nishiyori K.R. Nitta S. Noguchi Y. Noro R. Nurtdinov Y. Okazaki V. Orlando D. Paquette C.J.C. Parr O.J.L. Rackham P. Rizzu D.F. Sánchez Martinez A. Sandelin P. Sanjana C.A.M. Semple Y. Shibayama D.M. Sivaraman T. Suzuki S.C. Szumowski M. Tagami M.S. Taylor C. Terao M. Thodberg S. Thongjuea V. Tripathi I. Ulitsky R. Verardo I.E. Vorontsov C. Yamamoto R.S. Young J.K. Baillie A.R.R. Forrest R. Guigó M.M. Hoffman C.C. Hon T. Kasukawa S. Kauppinen J. Kere B. Lenhard C. Schneider H. Suzuki K. Yagi M.J.L. de Hoon J.W. Shin P. Carninci 01. Januar 2020 Computational genomics with R A. Akalin 15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit 07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Seite 3 Seite 4 … Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
01. Dezember 2020 / Ageing Res Rev Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence B. Uyar D. Palmer A. Kowald H.M. Escobar I. Barrantes S. Möller A. Akalin G. Fuellen
11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier
19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler
01. Juli 2020 / Genome Res Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping J.A. Ramilowski C.W. Yip S. Agrawal J.C. Chang Y. Ciani I.V. Kulakovskiy M. Mendez J.L.C. Ooi J.F. Ouyang N. Parkinson A. Petri L. Roos J. Severin K. Yasuzawa I. Abugessaisa A. Akalin I.V. Antonov E. Arner A. Bonetti H. Bono B. Borsari F. Brombacher C.J.F. Cameron C.V. Cannistraci R. Cardenas M. Cardon H. Chang J. Dostie L. Ducoli A. Favorov A. Fort D. Garrido N. Gil J. Gimenez R. Guler L. Handoko J. Harshbarger A. Hasegawa Y. Hasegawa K. Hashimoto N. Hayatsu P. Heutink T. Hirose E.L. Imada M. Itoh B. Kaczkowski A. Kanhere E. Kawabata H. Kawaji T. Kawashima S.T. Kelly M. Kojima N. Kondo H. Koseki T. Kouno A. Kratz M. Kurowska-Stolarska A.T.J. Kwon J. Leek A. Lennartsson M. Lizio F. López-Redondo J. Luginbühl S. Maeda V.J. Makeev L. Marchionni Y.A. Medvedeva A. Minoda F. Müller M. Muñoz-Aguirre M. Murata H. Nishiyori K.R. Nitta S. Noguchi Y. Noro R. Nurtdinov Y. Okazaki V. Orlando D. Paquette C.J.C. Parr O.J.L. Rackham P. Rizzu D.F. Sánchez Martinez A. Sandelin P. Sanjana C.A.M. Semple Y. Shibayama D.M. Sivaraman T. Suzuki S.C. Szumowski M. Tagami M.S. Taylor C. Terao M. Thodberg S. Thongjuea V. Tripathi I. Ulitsky R. Verardo I.E. Vorontsov C. Yamamoto R.S. Young J.K. Baillie A.R.R. Forrest R. Guigó M.M. Hoffman C.C. Hon T. Kasukawa S. Kauppinen J. Kere B. Lenhard C. Schneider H. Suzuki K. Yagi M.J.L. de Hoon J.W. Shin P. Carninci
15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit
07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler