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Wissenschaftliche Publikationen

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/ Bioinformatics

PEDL+: Protein-centered relation extraction from PubMed at your fingertip

  • L. Weber
  • F. Barth
  • L. Lorenz
  • F. Konrath
  • K. Huska
  • J. Wolf
  • U. Leser
/ Nat Biotechnol

Functional analysis of structural variants in single cells using Strand-seq

  • H. Jeong
  • K. Grimes
  • K.K. Rauwolf
  • P.M. Bruch
  • T. Rausch
  • P. Hasenfeld
  • E. Benito
  • T. Roider
  • R. Sabarinathan
  • D. Porubsky
  • S.A. Herbst
  • B. Erarslan-Uysal
  • J.C. Jann
  • T. Marschall
  • D. Nowak
  • J.P. Bourquin
  • A.E. Kulozik
  • S. Dietrich
  • B. Bornhauser
  • A.D. Sanders
  • J.O. Korbel
/ Nature

A draft human pangenome reference

  • W.W. Liao
  • M. Asri
  • J. Ebler
  • D. Doerr
  • M. Haukness
  • G. Hickey
  • S. Lu
  • J.K. Lucas
  • J. Monlong
  • H.J. Abel
  • S. Buonaiuto
  • X.H. Chang
  • H. Cheng
  • J. Chu
  • V. Colonna
  • J.M. Eizenga
  • X. Feng
  • C. Fischer
  • R.S. Fulton
  • S. Garg
  • C. Groza
  • A. Guarracino
  • W.T. Harvey
  • S. Heumos
  • K. Howe
  • M. Jain
  • T.Y. Lu
  • C. Markello
  • F.J. Martin
  • M.W. Mitchell
  • K.M. Munson
  • M.N. Mwaniki
  • A.M. Novak
  • H.E. Olsen
  • T. Pesout
  • D. Porubsky
  • P. Prins
  • J.A. Sibbesen
  • J. Sirén
  • C. Tomlinson
  • F. Villani
  • M.R. Vollger
  • L.L. Antonacci-Fulton
  • G. Baid
  • C.A. Baker
  • A. Belyaeva
  • K. Billis
  • A. Carroll
  • P.C. Chang
  • S. Cody
  • D.E. Cook
  • R.M. Cook-Deegan
  • O.E. Cornejo
  • M. Diekhans
  • P. Ebert
  • S. Fairley
  • O. Fedrigo
  • A.L. Felsenfeld
  • G. Formenti
  • A. Frankish
  • Yan Gao
  • N.A. Garrison
  • C.G. Giron
  • R.E. Green
  • L. Haggerty
  • K. Hoekzema
  • T. Hourlier
  • H.P. Ji
  • E.E. Kenny
  • B.A. Koenig
  • A. Kolesnikov
  • J.O. Korbel
  • J. Kordosky
  • S. Koren
  • H.J. Lee
  • A.P. Lewis
  • H. Magalhães
  • S. Marco-Sola
  • P. Marijon
  • A. McCartney
  • J. McDaniel
  • J. Mountcastle
  • M. Nattestad
  • S. Nurk
  • N.D. Olson
  • A.B. Popejoy
  • D. Puiu
  • M. Rautiainen
  • A.A. Regier
  • A. Rhie
  • S. Sacco
  • A.D. Sanders
  • V.A. Schneider
  • B.I. Schultz
  • K. Shafin
  • M.W. Smith
  • H.J. Sofia
  • A.N. Abou Tayoun
  • F. Thibaud-Nissen
  • F.F. Tricomi
  • J. Wagner
  • B. Walenz
  • J.M.D. Wood
  • A.V. Zimin
  • G. Bourque
  • M.J P Chaisson
  • Paul Flicek
  • A.M. Phillippy
  • J.M. Zook
  • E.E. Eichler
  • D. Haussler
  • T. Wang
  • E.D. Jarvis
  • K.H. Miga
  • E. Garrison
  • T. Marschall
  • I.M. Hall
  • H. Li
  • B. Paten
/ Genome Biol

Inversion polymorphism in a complete human genome assembly

  • D. Porubsky
  • W.T. Harvey
  • A.N. Rozanski
  • J. Ebler
  • W. Höps
  • H. Ashraf
  • P. Hasenfeld
  • B. Paten
  • A.D. Sanders
  • T. Marschall
  • J.O. Korbel
  • E.E. Eichler
/ Genome Res

Gaps and complex structurally variant loci in phased genome assemblies

  • D. Porubsky
  • M.R. Vollger
  • W.T. Harvey
  • A.N. Rozanski
  • P. Ebert
  • G. Hickey
  • P. Hasenfeld
  • A.D. Sanders
  • C. Stober
  • J.O. Korbel
  • B. Paten
  • T. Marschall
  • E.E. Eichler
/ Nat Biotechnol

Single-cell multi-omics allows functional characterization of structural variants

  • J.O. Korbel
  • A.D. Sanders
/ Nature

Semi-automated assembly of high-quality diploid human reference genomes

  • E.D. Jarvis
  • G. Formenti
  • A. Rhie
  • A. Guarracino
  • C. Yang
  • J. Wood
  • A. Tracey
  • F. Thibaud-Nissen
  • M.R. Vollger
  • D. Porubsky
  • H. Cheng
  • M. Asri
  • G.A. Logsdon
  • P. Carnevali
  • M.J.P. Chaisson
  • C.S. Chin
  • S. Cody
  • J. Collins
  • P. Ebert
  • M. Escalona
  • O. Fedrigo
  • R.S. Fulton
  • L.L. Fulton
  • S. Garg
  • J.L. Gerton
  • J. Ghurye
  • A. Granat
  • R.E. Green
  • W. Harvey
  • P. Hasenfeld
  • A. Hastie
  • M. Haukness
  • E.B. Jaeger
  • M. Jain
  • M. Kirsche
  • M. Kolmogorov
  • J.O. Korbel
  • S. Koren
  • J. Korlach
  • J. Lee
  • D. Li
  • T. Lindsay
  • J. Lucas
  • F. Luo
  • T. Marschall
  • M.W. Mitchell
  • J. McDaniel
  • F. Nie
  • H.E. Olsen
  • N.D. Olson
  • T. Pesout
  • T. Potapova
  • D. Puiu
  • A. Regier
  • J. Ruan
  • S.L. Salzberg
  • A.D. Sanders
  • M.C. Schatz
  • A. Schmitt
  • V.A. Schneider
  • S. Selvaraj
  • K. Shafin
  • A. Shumate
  • N.O. Stitziel
  • C. Stober
  • J. Torrance
  • J. Wagner
  • J. Wang
  • A. Wenger
  • C. Xiao
  • A.V. Zimin
  • G. Zhang
  • T. Wang
  • H. Li
  • E. Garrison
  • D. Haussler
  • I. Hall
  • J.M. Zook
  • E.E. Eichler
  • A.M. Phillippy
  • B. Paten
  • K. Howe
  • K.H. Miga
/ Genome Res

A high-resolution map of small-scale inversions in the gibbon genome

  • L. Mercuri
  • D. Palmisano
  • A. L'Abbate
  • P. D'Addabbo
  • F. Montinaro
  • C.R. Catacchio
  • P. Hasenfeld
  • M. Ventura
  • J.O. Korbel
  • A.D. Sanders
  • F.A.M. Maggiolini
  • F. Antonacci
/ Sci Immunol

C/EBPβ regulates lipid metabolism and Pparg isoform 2 expression in alveolar macrophages

  • D. Dörr
  • B. Obermayer
  • J.M. Weiner
  • K. Zimmermann
  • C. Anania
  • L.K. Wagner
  • E.M. Lyras
  • V. Sapozhnikova
  • D. Lara-Astiaso
  • F. Prósper
  • R. Lang
  • D.G. Lupiáñez
  • D. Beule
  • U.E. Höpken
  • A. Leutz
  • A. Mildner
/ EMBO Mol Med

Store-operated calcium entry controls innate and adaptive immune cell function in inflammatory bowel disease

  • M. Letizia
  • Y.H. Wang
  • U. Kaufmann
  • L. Gerbeth
  • A. Sand
  • M. Brunkhorst
  • P. Weidner
  • J.F. Ziegler
  • C. Böttcher
  • S. Schlickeiser
  • C. Fernández
  • M. Yamashita
  • K. Stauderman
  • K. Sun
  • D. Kunkel
  • M. Prakriya
  • A.D. Sanders
  • B. Siegmund
  • S. Feske
  • C. Weidinger