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in Nat Mach Intell

Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning

  • W. Kopp
  • A. Akalin
  • U. Ohler
in Cell Genom

Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos

  • A.C. McGarvey
  • W. Kopp
  • D. Vučićević
  • K. Mattonet
  • R. Kempfer
  • A. Hirsekorn
  • I. Bilić
  • M. Gil
  • A. Trinks
  • A.M. Merks
  • D. Panáková
  • A. Pombo
  • A. Akalin
  • J.P. Junker
  • D.Y.R. Stainier
  • D. Garfield
  • U. Ohler
  • S.A. Lacadie
in Dev Cell

FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells

  • E. Kolundzic
  • A. Ofenbauer
  • S.I. Bulut
  • B. Uyar
  • G. Baytek
  • A. Sommermeier
  • S. Seelk
  • M. He
  • A. Hirsekorn
  • D. Vucicevic
  • A. Akalin
  • S. Diecke
  • S.A. Lacadie
  • B. Tursun