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Wissenschaftliche Publikationen

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/ Cell

SARS-CoV-2 infection triggers profibrotic macrophage responses and lung fibrosis

  • D. Wendisch
  • O. Dietrich
  • T. Mari
  • S. von Stillfried
  • I.L. Ibarra
  • M. Mittermaier
  • C. Mache
  • R.L. Chua
  • R. Knoll
  • S. Timm
  • S. Brumhard
  • T. Krammer
  • H. Zauber
  • A.L. Hiller
  • A. Pascual-Reguant
  • R. Mothes
  • R.D. Bülow
  • J. Schulze
  • A.M. Leipold
  • S. Djudjaj
  • F. Erhard
  • R. Geffers
  • F. Pott
  • J. Kazmierski
  • J. Radke
  • P. Pergantis
  • K. Baßler
  • C. Conrad
  • A.C. Aschenbrenner
  • B. Sawitzki
  • M. Landthaler
  • E. Wyler
  • D. Horst
  • S. Hippenstiel
  • A. Hocke
  • F.L. Heppner
  • A. Uhrig
  • C. Garcia
  • F. Machleidt
  • S. Herold
  • S. Elezkurtaj
  • C. Thibeault
  • M. Witzenrath
  • C. Cochain
  • N. Suttorp
  • C. Drosten
  • C. Goffinet
  • F. Kurth
  • J.L. Schultze
  • H. Radbruch
  • M. Ochs
  • R. Eils
  • H. Müller-Redetzky
  • A.E. Hauser
  • M.D. Luecken
  • F.J. Theis
  • C. Conrad
  • T. Wolff
  • P. Boor
  • M. Selbach
  • A.E. Saliba
  • L.E. Sander
/ Med Genet

How to find genomic regions relevant for gene regulation

  • X. Guo
  • U. Ohler
  • F. Yildirim
/ Nat Commun

Spatio-temporal mRNA tracking in the early zebrafish embryo

  • K. Holler
  • A. Neuschulz
  • P. Drewe-Boß
  • J. Mintcheva
  • B. Spanjaard
  • R. Arsiè
  • U. Ohler
  • M. Landthaler
  • J.P. Junker
/ EMBO J

Ythdf is a N6-methyladenosine reader that modulates Fmr1 target mRNA selection and restricts axonal growth in Drosophila

  • L. Worpenberg
  • C. Paolantoni
  • S. Longhi
  • M.M. Mulorz
  • T. Lence
  • H.H. Wessels
  • E. Dassi
  • G. Aiello
  • F.X.R. Sutandy
  • M. Scheibe
  • R.R. Edupuganti
  • A. Busch
  • M.M. Möckel
  • M. Vermeulen
  • F. Butter
  • J. König
  • M. Notarangelo
  • U. Ohler
  • C. Dieterich
  • A. Quattrone
  • A. Soldano
  • J.Y. Roignant
/ BMC Genomics

Inferring time series chromatin states for promoter-enhancer pairs based on Hi-C data

  • H. Miko
  • Y. Qiu
  • B. Gaertner
  • M. Sander
  • U. Ohler
/ Mol Cell

Protein synthesis in the developing neocortex at near-atomic resolution reveals Ebp1-mediated neuronal proteostasis at the 60S tunnel exit

  • M.L. Kraushar
  • F. Krupp
  • D. Harnett
  • P. Turko
  • M.C. Ambrozkiewicz
  • T. Sprink
  • K. Imami
  • M. Günnigmann
  • U. Zinnall
  • C.H. Vieira-Vieira
  • T. Schaub
  • A. Münster-Wandowski
  • J. Bürger
  • E. Borisova
  • H. Yamamoto
  • M.R. Rasin
  • U. Ohler
  • D. Beule
  • T. Mielke
  • V. Tarabykin
  • M. Landthaler
  • G. Kramer
  • I. Vida
  • M. Selbach
  • C.M.T. Spahn
/ Methods Mol Biol

Genome-wide analysis of actively translated open reading frames using riboTaper/ORFquant

  • D. Harnett
  • E. Meerdink
  • L. Calviello
  • D. Sydow
  • U. Ohler
/ Bioinformatics

SSMART: Sequence-structure motif identification for RNA-binding proteins

  • A. Munteanu
  • N. Mukherjee
  • U. Ohler
/ Genome Biol

omniCLIP: probabilistic identification of protein-RNA interactions from CLIP-seq data

  • P. Drewe-Boss
  • H.H. Wessels
  • U. Ohler
/ Nat Commun

Determinants of promoter and enhancer transcription directionality in metazoans

  • M.M. Ibrahim
  • A. Karabacak
  • A. Glahs
  • E. Kolundzic
  • A. Hirsekorn
  • A. Carda
  • B. Tursun
  • R.P. Zinzen
  • S.A. Lacadie
  • U. Ohler