Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Adami, Eleonora Dr. (3) Altmueller, Janine Dr.med. (3) Barke, Niclas (1) Beule, Dieter Dr. (8) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (2) Blachut, Susanne (1) Blume, Alexander Dr. (1) Blüthgen, Nils (6) Borodina, Tatiana Dr. (2) Burkert, Christian Martin (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (3) Chen, Chia-Yu (1) Chen, Wei Prof. Dr. (3) Del Giudice, Simone (2) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Falcke, Martin Prof. Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (6) Freimuth, Jonas (1) Fritsche, Raphaela Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (5) Gil, Marine (1) Golusik, Sabrina (1) Gorski, Stan Dr. (1) Gotthardt, Michael Prof. Dr. (3) Graf, Robin Dr. (1) Grobe, Jenny (1) Harabula, Izabela-Cezara (4) Heinemann, Udo Prof. Dr. (3) Henssen, Anton Prof. Dr. med. (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (1) Hinze, Christian Dr. med. Dipl.-Math. (1) Hirsekorn, Antje (12) Hübner, Norbert Prof. Dr. (7) Hummel, Oliver (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (5) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (2) Kastelic, Nicolai (4) Kaufmann, Tom (1) Kempa, Stefan Dr. (8) Kettenmann, Helmut Prof. Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (3) Kocks, Christine Dr. (5) Krabbe, Grietje Dr. (1) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (6) Kunz, Severine Dr. (1) Lacadie, Scott Allen Dr. (10) Lahmann, Ines Dr. (1) Landthaler, Markus Prof. Dr. (117) Lindberg, Eric Lars-Helge (1) Lupianez Garcia, Dario Jesus Dr. (1) Maatz, Henrike Dr. (3) Markowski, Julia (1) Mastrobuoni, Guido Dr. (8) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (2) Minia, Igor Dr. (5) Mintcheva, Janita (1) Monti, Remo (3) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (1) Neuschulz, Anika (1) Obermayer-Wasserscheid, Benedikt Dr. (11) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (138) Oliveras Martinez, Anna Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Paul, Friedemann Prof. Dr. med. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (90) Preibisch, Stephan Dr. (1) Quedenau, Claudia (3) Radke, Michael Dr. (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (1) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (23) Rautenstrauch, Pia Josefine (2) Robson, Michael Dr. (1) Röefzaad, Claudia (1) Ruiz Orera, Jorge Dr. (1) Rybak-Wolf, Agnieszka Dr. (3) Sander, Maike Prof. Dr. (2) Scharek, Nadine (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Schütz, Anja Dr. (3) Schwarz, Roland Dr. (4) Selbach, Matthias Prof. Dr. (20) Serebreni, Leonid Dr. (1) Spanjaard, Bastiaan Dr. (1) Sprink, Thiemo Dr. (1) Streck, Adam Dr. (1) Szabo, Dominik (2) Teixeira Alves, Luiz Gustavo Dr. (7) Thieme, Christoph Dr. (3) Uyar, Bora Dr. (3) Vidal, Marie Dr. (1) Villamil, Gabriel (1) Wanker, Erich Prof. Dr. (2) Wei, Tzu Ting (1) Willemin, Andréa (1) Winick-Ng, Warren Dr. (3) Woehler, Andrew Dr. (2) Wolf, Jana Prof. Dr. (1) Wolf, Susanne Dr. (1) Wurmus, Ricardo (5) Wyler, Emanuel Dr. (54) Zauber, Henrik Dr. (4) Zea Redondo, Luna (2) Zenkner, Martina (1) Zinzen, Robert Patrick Dr. (3) (-) Akalin, Altuna Dr. (16) (-) Tursun, Baris Dr. (2) (-) Vucicevic, Dubravka (3) AG Müller/Dechend (ECRC) (11) Animal Phenotyping (3) Bioinformatics and Omics Data Science (73) (-) Bioinformatik der Genregulation (11) Biologie maligner Lymphome (4) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (4) Entwicklung und Funktion neuraler Netzwerke (1) (-) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (4) Experimentelle Ultrahochfeld-MR (28) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (6) Genetik von Angeborenen Herzerkrankungen (1) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (8) Genomdiversifikation & Integrität (2) Genomics (1) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (11) Hypertonie bedingte Endorganschäden (11) Immunmechanismen und humane Antikörper (2) Immunregulation und Krebs (10) Integrative Vaskuläre Biologie (1) Kardiale MRT (37) Magnetic Resonance (28) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Mobile DNA (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (8) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (3) Myologie (6) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (1) Neuroimmunologie-Labor (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (4) Pluripotent Stem Cells (2) Proteom Dynamik (6) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (2) Proteomics (4) Proteomics and Metabolomics (2) Quantitative Entwicklungsbiologie (1) (-) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (5) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (4) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (8) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (8) Translational Bioinformatics (1) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (1) Translationale Tumorimmunologie (2) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (1) 2015 (1) 2016 (1) 2017 (5) 2018 (2) 2019 (3) 2020 (1) 2021 (2) 2022 (3) 18 Ergebnisse: Active Filter: Akalin, Altuna Dr.Tursun, Baris Dr.Vucicevic, DubravkaBioinformatik der GenregulationEpigenetische Regulation und ChromatinstrukturRNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler 25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 10. September 2018 / Dev Cell FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells E. Kolundzic A. Ofenbauer S.I. Bulut B. Uyar G. Baytek A. Sommermeier S. Seelk M. He A. Hirsekorn D. Vucicevic A. Akalin S. Diecke S.A. Lacadie B. Tursun 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 16. Oktober 2017 / Mol Syst Biol RNA polymerase II primes Polycomb-repressed developmental genes throughout terminal neuronal differentiation C. Ferrai E. Torlai Triglia J.R. Risner-Janiczek T. Rito O.J.L. Rackham I. De Santiago A. Kukalev M. Nicodemi A. Akalin M. Li M.A. Ungless A. Pombo 31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler
25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
10. September 2018 / Dev Cell FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells E. Kolundzic A. Ofenbauer S.I. Bulut B. Uyar G. Baytek A. Sommermeier S. Seelk M. He A. Hirsekorn D. Vucicevic A. Akalin S. Diecke S.A. Lacadie B. Tursun
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
16. Oktober 2017 / Mol Syst Biol RNA polymerase II primes Polycomb-repressed developmental genes throughout terminal neuronal differentiation C. Ferrai E. Torlai Triglia J.R. Risner-Janiczek T. Rito O.J.L. Rackham I. De Santiago A. Kukalev M. Nicodemi A. Akalin M. Li M.A. Ungless A. Pombo
31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin