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in EMBO J

Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence

  • M. Kolesnichenko
  • N. Mikuda
  • U.E. Höpken
  • E. Kärgel
  • B. Uyar
  • A.B. Tufan
  • M. Milanovic
  • W. Sun
  • I. Krahn
  • K. Schleich
  • L. von Hoff
  • M. Hinz
  • M. Willenbrock
  • S. Jungmann
  • A. Akalin
  • S. Lee
  • R. Schmidt-Ullrich
  • C.A. Schmitt
  • C. Scheidereit
in Nat Commun

Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells

  • M. Kim
  • V. Franke
  • B. Brandt
  • E.D. Lowenstein
  • V. Schöwel
  • S. Spuler
  • A. Akalin
  • C. Birchmeier
in J Comp Neurol

Polysialic acid in the rat brainstem and thoracolumbar spinal cord: distribution, cellular location and comparison with mouse

  • S. Shahbazian
  • P. Bokiniec
  • B.A. Berning
  • S. McMullan
  • A.K. Goodchild
in Ageing Res Rev

Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence

  • B. Uyar
  • D. Palmer
  • A. Kowald
  • H.M. Escobar
  • I. Barrantes
  • S. Möller
  • A. Akalin
  • G. Fuellen
in Trends Biochem Sci

Charting a DNA repair roadmap for immunoglobulin class switch recombination

  • T. Saha
  • D. Sundaravinayagam
  • M. Di Virgilio
in J Exp Med

PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification

  • V. Delgado-Benito
  • M. Berruezo-Llacuna
  • R. Altwasser
  • W. Winkler
  • D. Sundaravinayagam
  • S. Balasubramanian
  • M. Caganova
  • R. Graf
  • A. Rahjouei
  • M.T. Henke
  • M. Driesner
  • L. Keller
  • A. Prigione
  • M. Janz
  • A. Akalin
  • M. Di Virgilio
in Nat Commun

Deep learning for genomics using Janggu

  • W. Kopp
  • R. Monti
  • A. Tamburrini
  • U. Ohler
  • A. Akalin
in Genome Res

Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping

  • J.A. Ramilowski
  • C.W. Yip
  • S. Agrawal
  • J.C. Chang
  • Y. Ciani
  • I.V. Kulakovskiy
  • M. Mendez
  • J.L.C. Ooi
  • J.F. Ouyang
  • N. Parkinson
  • A. Petri
  • L. Roos
  • J. Severin
  • K. Yasuzawa
  • I. Abugessaisa
  • A. Akalin
  • I.V. Antonov
  • E. Arner
  • A. Bonetti
  • H. Bono
  • B. Borsari
  • F. Brombacher
  • C.J.F. Cameron
  • C.V. Cannistraci
  • R. Cardenas
  • M. Cardon
  • H. Chang
  • J. Dostie
  • L. Ducoli
  • A. Favorov
  • A. Fort
  • D. Garrido
  • N. Gil
  • J. Gimenez
  • R. Guler
  • L. Handoko
  • J. Harshbarger
  • A. Hasegawa
  • Y. Hasegawa
  • K. Hashimoto
  • N. Hayatsu
  • P. Heutink
  • T. Hirose
  • E.L. Imada
  • M. Itoh
  • B. Kaczkowski
  • A. Kanhere
  • E. Kawabata
  • H. Kawaji
  • T. Kawashima
  • S.T. Kelly
  • M. Kojima
  • N. Kondo
  • H. Koseki
  • T. Kouno
  • A. Kratz
  • M. Kurowska-Stolarska
  • A.T.J. Kwon
  • J. Leek
  • A. Lennartsson
  • M. Lizio
  • F. López-Redondo
  • J. Luginbühl
  • S. Maeda
  • V.J. Makeev
  • L. Marchionni
  • Y.A. Medvedeva
  • A. Minoda
  • F. Müller
  • M. Muñoz-Aguirre
  • M. Murata
  • H. Nishiyori
  • K.R. Nitta
  • S. Noguchi
  • Y. Noro
  • R. Nurtdinov
  • Y. Okazaki
  • V. Orlando
  • D. Paquette
  • C.J.C. Parr
  • O.J.L. Rackham
  • P. Rizzu
  • D.F. Sánchez Martinez
  • A. Sandelin
  • P. Sanjana
  • C.A.M. Semple
  • Y. Shibayama
  • D.M. Sivaraman
  • T. Suzuki
  • S.C. Szumowski
  • M. Tagami
  • M.S. Taylor
  • C. Terao
  • M. Thodberg
  • S. Thongjuea
  • V. Tripathi
  • I. Ulitsky
  • R. Verardo
  • I.E. Vorontsov
  • C. Yamamoto
  • R.S. Young
  • J.K. Baillie
  • A.R.R. Forrest
  • R. Guigó
  • M.M. Hoffman
  • C.C. Hon
  • T. Kasukawa
  • S. Kauppinen
  • J. Kere
  • B. Lenhard
  • C. Schneider
  • H. Suzuki
  • K. Yagi
  • M.J.L. de Hoon
  • J.W. Shin
  • P. Carninci
in PLoS Genet

Age-of-onset information helps identify 76 genetic variants associated with allergic disease

  • M.A.R. Ferreira
  • J.M. Vonk
  • H. Baurecht
  • I. Marenholz
  • C. Tian
  • J.D. Hoffman
  • Q. Helmer
  • A. Tillander
  • Vi. Ullemar
  • Y. Lu
  • S. Grosche
  • F. Rüschendorf
  • R. Granell
  • B.M. Brumpton
  • L.G. Fritsche
  • L. Bhatta
  • M.E. Gabrielsen
  • J.B. Nielsen
  • W. Zhou
  • K. Hveem
  • A. Langhammer
  • O.L. Holmen
  • M. Løset
  • G.R. Abecasis
  • C.J. Willer
  • N.C. Emami
  • T.B. Cavazos
  • J.S. Witte
  • A. Szwajda
  • D.A. Hinds
  • N. Hübner
  • S. Weidinger
  • P.K. Magnusson
  • E. Jorgenson
  • R. Karlsson
  • L. Paternoster
  • D.I. Boomsma
  • C. Almqvist
  • Y.A. Lee
  • G.H. Koppelman
in Proc Natl Acad Sci U S A

Functional interplay of Epstein-Barr virus oncoproteins in a mouse model of B cell lymphomagenesis

  • T. Sommermann
  • T. Yasuda
  • J. Ronen
  • T. Wirtz
  • T. Weber
  • U. Sack
  • R. Caeser
  • J. Zhang
  • X. Li
  • V.T. Chu
  • A. Jauch
  • K. Unger
  • D.J. Hodson
  • A. Akalin
  • K. Rajewsky