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Veröffentlichungen

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in Nucleic Acids Res

HOT or not: examining the basis of high-occupancy target regions

  • K. Wreczycka
  • V. Franke
  • B. Uyar
  • R. Wurmus
  • S. Bulut
  • B. Tursun
  • A. Akalin
in Nat Commun

Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila

  • H.H. Wessels
  • S. Lebedeva
  • A. Hirsekorn
  • R. Wurmus
  • A. Akalin
  • N. Mukherjee
  • U. Ohler
in Leukemia

Intracellular expression of FLT3 in Purkinje cells: implications for adoptive T-cell therapies

  • N. Çakmak-Görür
  • J. Radke
  • S. Rhein
  • E. Schumann
  • G. Willimsky
  • F.L. Heppner
  • T. Blankenstein
  • A. Pezzutto
in Genome Biol

Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling

  • A. Karabacak Calviello
  • A. Hirsekorn
  • R. Wurmus
  • D. Yusuf
  • U. Ohler
in Methods Mol Biol

Scalable workflows and reproducible data analysis for genomics

  • F. Strozzi
  • R. Janssen
  • R. Wurmus
  • M.R. Crusoe
  • G. Githinji
  • P. Di Tommaso
  • D. Belhachemi
  • S. Möller
  • G. Smant
  • J. de Ligt
  • P. Prins
in GigaScience

PiGx: reproducible genomics analysis pipelines with GNU Guix

  • R. Wurmus
  • B. Uyar
  • B. Osberg
  • V. Franke
  • A. Gosdschan
  • K. Wreczycka
  • J. Ronen
  • A. Akalin
in Nucleic Acids Res

RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest

  • B. Uyar
  • D. Yusuf
  • R. Wurmus
  • N. Rajewsky
  • U. Ohler
  • A. Akalin
in Nat Commun

Meta-analysis identifies seven susceptibility loci involved in the atopic march

  • I. Marenholz
  • J. Esparza-Gordillo
  • F. Rüschendorf
  • A. Bauerfeind
  • D.P. Strachan
  • B.D. Spycher
  • H. Baurecht
  • P. Margaritte-Jeannin
  • A. Sääf
  • M. Kerkhof
  • M. Ege
  • S. Baltic
  • M.C. Matheson
  • J. Li
  • S. Michel
  • W.Q. Ang
  • W. McArdle
  • A. Arnold
  • G. Homuth
  • F. Demenais
  • E. Bouzigon
  • C. Söderhäll
  • G. Pershagen
  • J.C. de Jongste
  • D.S. Postma
  • C. Braun-Fahrlaender
  • E. Horak
  • L.M. Ogorodova
  • V.P. Puzyrev
  • E.Y. Bragina
  • T.J. Hudson
  • C. Morin
  • D.L. Duffy
  • G.B. Marks
  • C.F. Robertson
  • G.W. Montgomery
  • B. Musk
  • P.J. Thompson
  • N.G. Martin
  • A. James
  • P. Sleiman
  • E. Toskala
  • E. Rodriguez
  • R. Fölster-Holst
  • A. Franke
  • W. Lieb
  • C. Gieger
  • A. Heinzmann
  • E. Rietschel
  • T. Keil
  • S. Cichon
  • M.M. Nöthen
  • C.E. Pennell
  • P.D. Sly
  • C.O. Schmidt
  • A. Matanovic
  • V. Schneider
  • M. Heinig
  • N. Hübner
  • P.G. Holt
  • S. Lau
  • M. Kabesch
  • S. Weidinger
  • H. Hakonarson
  • M.A.R. Ferreira
  • C. Laprise
  • M.B. Freidin
  • J. Genuneit
  • G.H. Koppelman
  • E. Melén
  • M.H. Dizier
  • A.J. Henderson
  • Y.A. Lee
in Mol Oncol

Potent anti-tumor response by targeting B cell maturation antigen (BCMA) in a mouse model of multiple myeloma

  • F. Oden
  • S.F. Marino
  • J. Brand
  • S. Scheu
  • C. Kriegel
  • D. Olal
  • A. Takvorian
  • J. Westermann
  • B. Yilmaz
  • M. Hinz
  • O. Daumke
  • U.E. Höpken
  • G. Müller
  • M. Lipp
in Nucleic Acids Res

DoRiNA 2.0-upgrading the doRiNA database of RNA interactions in post-transcriptional regulation

  • K. Blin
  • C. Dieterich
  • R. Wurmus
  • N. Rajewsky
  • M. Landthaler
  • A. Akalin