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in Nat Commun

Determinants of promoter and enhancer transcription directionality in metazoans

  • M.M. Ibrahim
  • A. Karabacak
  • A. Glahs
  • E. Kolundzic
  • A. Hirsekorn
  • A. Carda
  • B. Tursun
  • R.P. Zinzen
  • S.A. Lacadie
  • U. Ohler
in Curr Opin Syst Biol

Editorial overview

  • S. Shvartsman
  • R. Zinzen
in Cell

Mutations in disordered regions can cause disease by creating dileucine motifs

  • K. Meyer
  • M. Kirchner
  • B. Uyar
  • J.Y. Cheng
  • G. Russo
  • L.R. Hernandez-Miranda
  • A. Szymborska
  • H. Zauber
  • I.M. Rudolph
  • T.E. Willnow
  • A. Akalin
  • V. Haucke
  • H. Gerhardt
  • C. Birchmeier
  • R. Kühn
  • M. Krauss
  • S. Diecke
  • J.M. Pascual
  • M. Selbach
in Dev Cell

FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells

  • E. Kolundzic
  • A. Ofenbauer
  • S.I. Bulut
  • B. Uyar
  • G. Baytek
  • A. Sommermeier
  • S. Seelk
  • M. He
  • A. Hirsekorn
  • D. Vucicevic
  • A. Akalin
  • S. Diecke
  • S.A. Lacadie
  • B. Tursun
in Genome Biol

McEnhancer: predicting gene expression via semi-supervised assignment of enhancers to target genes

  • D. Hafez
  • A. Karabacak
  • S. Krueger
  • Y.C. Hwang
  • L.S. Wang
  • R.P. Zinzen
  • U. Ohler
in Science

The Drosophila embryo at single-cell transcriptome resolution

  • N. Karaiskos
  • P. Wahle
  • J. Alles
  • A. Boltengagen
  • S. Ayoub
  • C. Kipar
  • C. Kocks
  • N. Rajewsky
  • R.P. Zinzen
in BMC Biol

Cell fixation and preservation for droplet-based single-cell transcriptomics

  • J. Alles
  • N. Karaiskos
  • S.D. Praktiknjo
  • S. Grosswendt
  • P. Wahle
  • P.L. Ruffault
  • S. Ayoub
  • L. Schreyer
  • A. Boltengagen
  • C. Birchmeier
  • R. Zinzen
  • C. Kocks
  • N. Rajewsky