Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mathas, Stephan Dr. (3) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Franke, Vedran Dr. (22) Advanced Light Microscopy (35) AG Müller/Dechend (ECRC) (4) Animal Phenotyping (2) Ankerproteine und Signaltransduktion (1) Berechnungsmethoden und omic Analytik (1) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (23) Bioinformatik der Genregulation (1) Bioinformatik der RNA-Struktur und Transkriptomregulierung (1) Biologie maligner Lymphome (5) Biomedizinische Bildanalyse (1) Electron Microscopy (1) Endokrinologie, Diabetes und Stoffwechselmedizin (5) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (5) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (2) Gastrointestinale Barriere, Regeneration und Karzinogenese (1) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (6) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (2) Genomdiversifikation & Integrität (3) Genomics (2) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (4) Hypertonie bedingte Endorganschäden (4) Immunregulation und Krebs (2) Intrazelluläre Proteolyse (3) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (6) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (2) Molekulare Immunologie und Gentherapie (1) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (8) Molekulare Signalwege in der kortikalen Entwicklung (3) Myologie (7) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (1) Neuroimmunologie-Labor (1) Neuronale Schaltkreise und Verhalten (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (5) Organoids (1) Pluripotent Stem Cells (1) Protein Production and Characterization (1) Proteom Dynamik (6) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (3) Proteomics (2) Proteomics and Metabolomics (1) Psychoneuroimmunologie (1) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (6) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (4) Synaptische Transmission und Plastitzität (1) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (8) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (2) Translational Bioinformatics (4) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (1) Translationale Onkologie solider Tumore (1) Translationale Tumorimmunologie (3) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (1) Wirt-Mikrobiom Faktoren in Herz-Kreislauferkrankungen (1) Zelluläre Neurowissenschaften (25) 2015 (1) 2017 (2) 2018 (1) 2019 (4) 2020 (2) 2021 (5) 2022 (4) 2023 (4) 23 Ergebnisse: Active Filter: Franke, Vedran Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 26. April 2022 / Front Immunol Rapid inflammasome activation is attenuated in post-myocardial infarction monocytes H. Giral V. Franke M. Moobed M.F. Müller L. Lübking D.M. James J. Hartung K. Kuschnerus D. Meteva C. Seppelt P. Jakob R. Klingenberg N. Kränkel D. Leistner T. Zeller S. Blankenberg F. Zimmermann A. Haghikia T.F. Lüscher A. Akalin U. Landmesser A. Kratzer 07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas 30. November 2023 / Nat Commun The SPOC proteins DIDO3 and PHF3 co-regulate gene expression and neuronal differentiation J. Benedum V. Franke L.M. Appel L. Walch M. Bruno R. Schneeweiss J. Gruber H. Oberndorfer E. Frank X. Strobl A. Polyansky B. Zagrovic A. Akalin D. Slade 06. Dezember 2021 / Genome Biol The SEQC2 epigenomics quality control (EpiQC) study J. Foox J. Nordlund C. Lalancette T. Gong M. Lacey S. Lent B.W. Langhorst V.K.C. Ponnaluri L. Williams K.R. Padmanabhan R. Cavalcante A. Lundmark D. Butler C. Mozsary J. Gurvitch J.M. Greally M. Suzuki M. Menor M. Nasu A. Alonso C. Sheridan A. Scherer S. Bruinsma G. Golda A. Muszynska P.P. Łabaj M.A. Campbell F. Wos A. Raine U. Liljedahl T. Axelsson C. Wang Z. Chen Z. Yang J. Li X. Yang H. Wang A. Melnick S. Guo A. Blume V. Franke I. Ibanez de Caceres C. Rodriguez-Antolin R. Rosas J.W. Davis J. Ishii D.B. Megherbi W. Xiao W. Liao J. Xu H. Hong B. Ning W. Tong A. Akalin Y. Wang Y. Deng C.E. Mason 30. Mai 2022 / Genome Biol Identifying tumor cells at the single-cell level using machine learning J. Dohmen A. Baranovskii J. Ronen B. Uyar V. Franke A. Akalin 19. Oktober 2021 / Nat Commun PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC L.M. Appel V. Franke M. Bruno I. Grishkovskaya A. Kasiliauskaite T. Kaufmann U.E. Schoeberl M.G. Puchinger S. Kostrhon C. Ebenwaldner M. Sebesta E. Beltzung K. Mechtler G. Lin A. Vlasova M. Leeb R. Pavri A. Stark A. Akalin R. Stefl C. Bernecky K. Djinovic-Carugo D. Slade 26. Oktober 2021 / Cell Rep Lymphocyte access to lymphoma is impaired by high endothelial venule regression L. Menzel M. Zschummel T. Crowley V. Franke M. Grau C. Ulbricht A. Hauser V. Siffrin M. Bajénoff S.E. Acton A. Akalin G. Lenz G. Willimsky U.E. Höpken A. Rehm 25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo 20. Dezember 2022 / Sci Total Environ SARS-CoV-2 infection dynamics revealed by wastewater sequencing analysis and deconvolution V.F. Schumann R.R. de Castro Cuadrat E. Wyler R. Wurmus A. Deter C. Quedenau J. Dohmen M. Faxel T. Borodina A. Blume J. Freimuth M. Meixner J.H. Grau K. Liere T. Hackenbeck F. Zietzschmann R. Gnirss U. Böckelmann B. Uyar V. Franke N. Barke J. Altmüller N. Rajewsky M. Landthaler A. Akalin 15. November 2022 / Cancers Multi-omics alleviates the limitations of panel sequencing for cancer drug response prediction A. Baranovskii I.B. Gündüz V. Franke B. Uyar A. Akalin Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Seite 3 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
26. April 2022 / Front Immunol Rapid inflammasome activation is attenuated in post-myocardial infarction monocytes H. Giral V. Franke M. Moobed M.F. Müller L. Lübking D.M. James J. Hartung K. Kuschnerus D. Meteva C. Seppelt P. Jakob R. Klingenberg N. Kränkel D. Leistner T. Zeller S. Blankenberg F. Zimmermann A. Haghikia T.F. Lüscher A. Akalin U. Landmesser A. Kratzer
07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas
30. November 2023 / Nat Commun The SPOC proteins DIDO3 and PHF3 co-regulate gene expression and neuronal differentiation J. Benedum V. Franke L.M. Appel L. Walch M. Bruno R. Schneeweiss J. Gruber H. Oberndorfer E. Frank X. Strobl A. Polyansky B. Zagrovic A. Akalin D. Slade
06. Dezember 2021 / Genome Biol The SEQC2 epigenomics quality control (EpiQC) study J. Foox J. Nordlund C. Lalancette T. Gong M. Lacey S. Lent B.W. Langhorst V.K.C. Ponnaluri L. Williams K.R. Padmanabhan R. Cavalcante A. Lundmark D. Butler C. Mozsary J. Gurvitch J.M. Greally M. Suzuki M. Menor M. Nasu A. Alonso C. Sheridan A. Scherer S. Bruinsma G. Golda A. Muszynska P.P. Łabaj M.A. Campbell F. Wos A. Raine U. Liljedahl T. Axelsson C. Wang Z. Chen Z. Yang J. Li X. Yang H. Wang A. Melnick S. Guo A. Blume V. Franke I. Ibanez de Caceres C. Rodriguez-Antolin R. Rosas J.W. Davis J. Ishii D.B. Megherbi W. Xiao W. Liao J. Xu H. Hong B. Ning W. Tong A. Akalin Y. Wang Y. Deng C.E. Mason
30. Mai 2022 / Genome Biol Identifying tumor cells at the single-cell level using machine learning J. Dohmen A. Baranovskii J. Ronen B. Uyar V. Franke A. Akalin
19. Oktober 2021 / Nat Commun PHF3 regulates neuronal gene expression through the Pol II CTD reader domain SPOC L.M. Appel V. Franke M. Bruno I. Grishkovskaya A. Kasiliauskaite T. Kaufmann U.E. Schoeberl M.G. Puchinger S. Kostrhon C. Ebenwaldner M. Sebesta E. Beltzung K. Mechtler G. Lin A. Vlasova M. Leeb R. Pavri A. Stark A. Akalin R. Stefl C. Bernecky K. Djinovic-Carugo D. Slade
26. Oktober 2021 / Cell Rep Lymphocyte access to lymphoma is impaired by high endothelial venule regression L. Menzel M. Zschummel T. Crowley V. Franke M. Grau C. Ulbricht A. Hauser V. Siffrin M. Bajénoff S.E. Acton A. Akalin G. Lenz G. Willimsky U.E. Höpken A. Rehm
25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo
20. Dezember 2022 / Sci Total Environ SARS-CoV-2 infection dynamics revealed by wastewater sequencing analysis and deconvolution V.F. Schumann R.R. de Castro Cuadrat E. Wyler R. Wurmus A. Deter C. Quedenau J. Dohmen M. Faxel T. Borodina A. Blume J. Freimuth M. Meixner J.H. Grau K. Liere T. Hackenbeck F. Zietzschmann R. Gnirss U. Böckelmann B. Uyar V. Franke N. Barke J. Altmüller N. Rajewsky M. Landthaler A. Akalin
15. November 2022 / Cancers Multi-omics alleviates the limitations of panel sequencing for cancer drug response prediction A. Baranovskii I.B. Gündüz V. Franke B. Uyar A. Akalin