Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Adami, Eleonora Dr. (1) Beule, Dieter Dr. (2) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (1) Blachut, Susanne (1) Burkert, Christian Martin (1) Chekulaeva, Marina Dr. (1) Chen, Chia-Yu (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Franke, Vedran Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (5) Gil, Marine (1) Gotthardt, Michael Prof. Dr. (2) Henssen, Anton Prof. Dr. med. (1) Hirsekorn, Antje (12) Hübner, Norbert Prof. Dr. (2) Hummel, Oliver (1) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (2) Kaufmann, Tom (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Lacadie, Scott Allen Dr. (10) Landthaler, Markus Prof. Dr. (10) Lindberg, Eric Lars-Helge (1) Maatz, Henrike Dr. (1) Mastrobuoni, Guido Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Mintcheva, Janita (1) Monti, Remo (3) Müthel, Stefanie (1) Neuschulz, Anika (1) Obermayer-Wasserscheid, Benedikt Dr. (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (138) Panakova, Daniela Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (5) Rautenstrauch, Pia Josefine (2) Ruiz Orera, Jorge Dr. (1) Sander, Maike Prof. Dr. (1) Schwarz, Roland Dr. (2) Selbach, Matthias Prof. Dr. (9) Spanjaard, Bastiaan Dr. (1) Sprink, Thiemo Dr. (1) Streck, Adam Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (2) Uyar, Bora Dr. (2) Villamil, Gabriel (1) Vucicevic, Dubravka (3) Woehler, Andrew Dr. (1) Wurmus, Ricardo (3) Wyler, Emanuel Dr. (3) Zauber, Henrik Dr. (2) Zinzen, Robert Patrick Dr. (3) (-) Akalin, Altuna Dr. (9) (-) Merks, Anne Margarete Dr. (1) (-) Müller, Thomas Dr. (1) (-) Röefzaad, Claudia (1) Advanced Light Microscopy (1) AG Müller/Dechend (ECRC) (1) Animal Phenotyping (1) Bioinformatics and Omics Data Science (73) (-) Bioinformatik der Genregulation (10) Biologie maligner Lymphome (4) Chromatindysfunktion bei Erkrankungen (1) Electron Microscopy (1) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (26) Entwicklungsneurobiologie (1) Entwicklung und Funktion neuraler Netzwerke (1) Epigenetische Modifikationen in Neuroblastom (2) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (4) Genetik metabolischer und reproduktiver Störungen (3) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (2) Genetik von Angeborenen Herzerkrankungen (1) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (4) Genomdiversifikation & Integrität (2) Genomics (1) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (1) Hypertonie bedingte Endorganschäden (1) Immunregulation und Krebs (6) Integrative Vaskuläre Biologie (1) Mathematische Zellphysiologie (1) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (2) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (2) Myologie (2) Neuroimmunologie-Labor (1) Neuronale Schaltkreise und Verhalten (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (4) Pluripotent Stem Cells (3) Proteom Dynamik (7) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (1) Proteomics (5) Proteomics and Metabolomics (6) Quantitative Entwicklungsbiologie (1) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (6) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (7) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (9) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (4) Translational Bioinformatics (6) Translationale Onkologie solider Tumore (3) Translationale Tumorimmunologie (2) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (2) Tumorheterogenität und Therapieresistenz in pädiatrischen Tumoren (1) Wirt-Mikrobiom Faktoren in Herz-Kreislauferkrankungen (4) Zelluläre Neurowissenschaften (1) 2017 (3) 2018 (1) 2019 (2) 2020 (2) 2022 (2) 10 Ergebnisse: Active Filter: Akalin, Altuna Dr.Merks, Anne Margarete Dr.Müller, Thomas Dr.Röefzaad, ClaudiaBioinformatik der Genregulation Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler 10. September 2018 / Dev Cell FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells E. Kolundzic A. Ofenbauer S.I. Bulut B. Uyar G. Baytek A. Sommermeier S. Seelk M. He A. Hirsekorn D. Vucicevic A. Akalin S. Diecke S.A. Lacadie B. Tursun 01. Januar 2020 / Nat Genet Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma R.P. Koche E. Rodriguez-Fos K. Helmsauer M. Burkert I.C. MacArthur J. Maag R. Chamorro N. Munoz-Perez M. Puiggròs H. Dorado Garcia Y. Bei C. Röefzaad V. Bardinet A. Szymansky A. Winkler T. Thole N. Timme K. Kasack S. Fuchs F. Klironomos N. Thiessen E. Blanc K. Schmelz A. Künkele P. Hundsdörfer C. Rosswog J. Theissen D. Beule H. Deubzer S. Sauer J. Toedling M. Fischer F. Hertwig R.F. Schwarz A. Eggert D. Torrents J.H. Schulte A.G. Henssen 09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler
10. September 2018 / Dev Cell FACT sets a barrier for cell fate reprogramming in Caenorhabditis elegans and human cells E. Kolundzic A. Ofenbauer S.I. Bulut B. Uyar G. Baytek A. Sommermeier S. Seelk M. He A. Hirsekorn D. Vucicevic A. Akalin S. Diecke S.A. Lacadie B. Tursun
01. Januar 2020 / Nat Genet Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma R.P. Koche E. Rodriguez-Fos K. Helmsauer M. Burkert I.C. MacArthur J. Maag R. Chamorro N. Munoz-Perez M. Puiggròs H. Dorado Garcia Y. Bei C. Röefzaad V. Bardinet A. Szymansky A. Winkler T. Thole N. Timme K. Kasack S. Fuchs F. Klironomos N. Thiessen E. Blanc K. Schmelz A. Künkele P. Hundsdörfer C. Rosswog J. Theissen D. Beule H. Deubzer S. Sauer J. Toedling M. Fischer F. Hertwig R.F. Schwarz A. Eggert D. Torrents J.H. Schulte A.G. Henssen
09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie