Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (1) Blume, Alexander Dr. (1) Chekulaeva, Marina Dr. (1) Fielitz, Jens Dr. (2) Franke, Vedran Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (1) Landthaler, Markus Prof. Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (3) Pombo, Ana Prof. Dr. (1) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (3) Saar, Kathrin Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (1) Spuler, Simone Prof. (3) Uyar, Bora Dr. (2) Woehler, Andrew Dr. (1) Wurmus, Ricardo (1) Wyler, Emanuel Dr. (1) (-) Akalin, Altuna Dr. (12) (-) Kukalev, Alexander Dr. (1) (-) Müller, Thomas Dr. (1) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (12) Bioinformatik der Genregulation (3) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (8) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (2) Genetik metabolischer und reproduktiver Störungen (1) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (1) Immunregulation und Krebs (1) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (1) Proteom Dynamik (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (2) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (6) Systems Biology Imaging (1) Zellzustände und ihre Funktionsweisen (1) 2006 (2) 2007 (1) 2008 (1) (-) 2009 (3) 2010 (3) 2011 (1) 2012 (4) 2013 (3) (-) 2014 (3) 2015 (4) (-) 2017 (6) 2018 (6) 2019 (9) 2020 (7) 2021 (8) 2022 (6) 2023 (6) 2024 (1) 12 Ergebnisse: Active Filter: Akalin, Altuna Dr.Kukalev, Alexander Dr.Müller, Thomas Dr.Bioinformatics and Omics Data Science200920142017 Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 10. November 2017 / J Biotechnol Strategies for analyzing bisulfite sequencing data K. Wreczycka A. Gosdschan D. Yusuf B. Grüning Y. Assenov A. Akalin 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 16. Oktober 2017 / Mol Syst Biol RNA polymerase II primes Polycomb-repressed developmental genes throughout terminal neuronal differentiation C. Ferrai E. Torlai Triglia J.R. Risner-Janiczek T. Rito O.J.L. Rackham I. De Santiago A. Kukalev M. Nicodemi A. Akalin M. Li M.A. Ungless A. Pombo 31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 11. Dezember 2014 / Cell Rep DNA hydroxymethylation profiling reveals that WT1 mutations result in loss of TET2 function in acute myeloid leukemia R. Rampal A. Akalin J. Madzo A. Vasanthakumar E. Pronier J. Patel Y. Li J. Ahn O. Abdel-Wahab A. Shih C. Lu P.S. Ward J.J. Tsai T. Hricik V. Tosello J.E. Tallman X. Zhao D. Daniels Q. Dai L. Ciminio I. Aifantis C. He F. Fuks M.S. Tallman A. Ferrando S. Nimer E. Paietta C.B. Thompson J.D. Licht C.E. Mason L.A. Godley A. Melnick M.E. Figueroa R.L. Levine 18. Februar 2014 / Front Cell Neurosci NanoCAGE analysis of the mouse olfactory epithelium identifies the expression of vomeronasal receptors and of proximal LINE elements G. Pascarella D. Lazarevic C. Plessy N. Bertin A. Akalin C. Vlachouli R. Simone G.J. Faulkner S. Zucchelli J. Kawai C.O. Daub Y. Hayashizaki B. Lenhard P. Carninci S. Gustincich 20. März 2014 / Nature Two independent transcription initiation codes overlap on vertebrate core promoters V. Haberle N. Li Y. Hadzhiev C. Plessy C. Previti C. Nepal J. Gehrig X. Dong A. Akalin A.M. Suzuki W.F.J. van IJcken O. Armant M. Ferg U. Strähle P. Carninci F. Müller B. Lenhard 01. September 2009 / Dev Dyn Zebrafish enhancer detection (ZED) vector: a new tool to facilitate transgenesis and the functional analysis of cis-regulatory regions in zebrafish J. Bessa J.J. Tena E. de la Calle-Mustienes A. Fernandez-Minan S. Naranjo A. Fernandez L. Montoliu A. Akalin B. Lenhard F. Casares J.L. Gomez-Skarmeta Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
10. November 2017 / J Biotechnol Strategies for analyzing bisulfite sequencing data K. Wreczycka A. Gosdschan D. Yusuf B. Grüning Y. Assenov A. Akalin
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
16. Oktober 2017 / Mol Syst Biol RNA polymerase II primes Polycomb-repressed developmental genes throughout terminal neuronal differentiation C. Ferrai E. Torlai Triglia J.R. Risner-Janiczek T. Rito O.J.L. Rackham I. De Santiago A. Kukalev M. Nicodemi A. Akalin M. Li M.A. Ungless A. Pombo
31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
11. Dezember 2014 / Cell Rep DNA hydroxymethylation profiling reveals that WT1 mutations result in loss of TET2 function in acute myeloid leukemia R. Rampal A. Akalin J. Madzo A. Vasanthakumar E. Pronier J. Patel Y. Li J. Ahn O. Abdel-Wahab A. Shih C. Lu P.S. Ward J.J. Tsai T. Hricik V. Tosello J.E. Tallman X. Zhao D. Daniels Q. Dai L. Ciminio I. Aifantis C. He F. Fuks M.S. Tallman A. Ferrando S. Nimer E. Paietta C.B. Thompson J.D. Licht C.E. Mason L.A. Godley A. Melnick M.E. Figueroa R.L. Levine
18. Februar 2014 / Front Cell Neurosci NanoCAGE analysis of the mouse olfactory epithelium identifies the expression of vomeronasal receptors and of proximal LINE elements G. Pascarella D. Lazarevic C. Plessy N. Bertin A. Akalin C. Vlachouli R. Simone G.J. Faulkner S. Zucchelli J. Kawai C.O. Daub Y. Hayashizaki B. Lenhard P. Carninci S. Gustincich
20. März 2014 / Nature Two independent transcription initiation codes overlap on vertebrate core promoters V. Haberle N. Li Y. Hadzhiev C. Plessy C. Previti C. Nepal J. Gehrig X. Dong A. Akalin A.M. Suzuki W.F.J. van IJcken O. Armant M. Ferg U. Strähle P. Carninci F. Müller B. Lenhard
01. September 2009 / Dev Dyn Zebrafish enhancer detection (ZED) vector: a new tool to facilitate transgenesis and the functional analysis of cis-regulatory regions in zebrafish J. Bessa J.J. Tena E. de la Calle-Mustienes A. Fernandez-Minan S. Naranjo A. Fernandez L. Montoliu A. Akalin B. Lenhard F. Casares J.L. Gomez-Skarmeta