Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (22) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mathas, Stephan Dr. (3) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Kühn, Ralf Dr. (1) (-) Kukalev, Alexander Dr. (2) (-) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Advanced Light Microscopy (2) AG Müller/Dechend (ECRC) (5) Animal Phenotyping (3) Ankerproteine und Signaltransduktion (106) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (14) Bioinformatik der Genregulation (140) Clinical Research Unit (2) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (7) Entwicklungsneurobiologie (3) Entwicklung und Funktion neuraler Netzwerke (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (8) Experimentelle Ultrahochfeld-MR (1) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (5) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (144) Genomdiversifikation & Integrität (1) Genomics (2) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (5) Hypertonie bedingte Endorganschäden (5) Immunmechanismen und humane Antikörper (3) Immunregulation und Krebs (10) In situ Strukturbiologie (1) Integrative Vaskuläre Biologie (5) Kardiale MRT (1) Magnetic Resonance (1) Mathematische Modellierung zellulärer Prozesse (1) Mobile DNA (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (4) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (1) Molekulare Immunologie und Gentherapie (1) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (1) Molekulare Signalwege in der kortikalen Entwicklung (1) Myologie (2) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (1) Organoids (1) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (1) Pluripotent Stem Cells (7) Protein Production and Characterization (1) Proteom Dynamik (10) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (2) Proteomics (2) Psychoneuroimmunologie (3) Quantitative Entwicklungsbiologie (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (10) Stammzell-Modellierung der Entwicklung und Erkrankung (1) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (9) Synaptische Transmission und Plastitzität (2) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (7) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (144) Translational Bioinformatics (1) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (4) Wirt-Mikrobiom Faktoren in Herz-Kreislauferkrankungen (3) Zelluläre Neurowissenschaften (4) Zellzustände und ihre Funktionsweisen (1) 2017 (4) 2018 (2) 2019 (3) 2020 (1) 2021 (1) 2022 (3) 14 Ergebnisse: Active Filter: Kühn, Ralf Dr.Kukalev, Alexander Dr.Lacadie, Scott Allen Dr.Ohler, Uwe Prof. Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler 25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler
25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler