Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mathas, Stephan Dr. (3) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Franke, Vedran Dr. (22) AG Müller/Dechend (ECRC) (21) Animal Phenotyping (4) Ankerproteine und Signaltransduktion (3) Biobank (2) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (22) Bioinformatik der Genregulation (1) Biologie maligner Lymphome (4) Clinical Research Unit (6) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (3) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (2) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (3) Genomics (3) Hochschulambulanz für Pädiatrische Allergologie und Neurodermitis (2) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (21) Hypertonie bedingte Endorganschäden (21) Immunregulation und Krebs (1) Intrazelluläre Proteolyse (1) Klinik für Psychiatrie / Modul Psychiatrie des Alterns (1) Mathematische Modellierung zellulärer Prozesse (1) Mathematische Zellphysiologie (114) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Mobile DNA (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (4) Molekulare Epidemiologie (2) Molekulare Genetik allergischer Erkrankungen (2) Molekulare Immunologie und Gentherapie (2) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (13) Molekulare Signalwege in der kortikalen Entwicklung (1) Molekulare und Zelluläre Grundlagen des Verhaltens (1) Myologie (1) Neuroimmunologie-Labor (1) Neuronale Schaltkreise und Verhalten (2) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (4) Pluripotent Stem Cells (1) Protein Production and Characterization (1) Proteom Dynamik (6) Proteomics (3) Proteomics and Metabolomics (7) Quantitative Entwicklungsbiologie (1) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (5) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (3) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (7) Systems Biology Imaging (2) Translational Bioinformatics (3) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (2) Translationale Tumorimmunologie (2) Wirt-Mikrobiom Faktoren in Herz-Kreislauferkrankungen (120) Zelluläre Neurowissenschaften (3) 2015 (1) 2017 (2) 2018 (1) 2019 (4) 2020 (1) 2021 (5) 2022 (4) 2023 (4) 22 Ergebnisse: Active Filter: Franke, Vedran Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 01. April 2015 / Bioinformatics genomation: a toolkit to summarize, annotate and visualize genomic intervals A. Akalin V. Franke K. Vlahoviček C.E. Mason D. Schübeler 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler 19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler 30. November 2023 / Nat Commun The SPOC proteins DIDO3 and PHF3 co-regulate gene expression and neuronal differentiation J. Benedum V. Franke L.M. Appel L. Walch M. Bruno R. Schneeweiss J. Gruber H. Oberndorfer E. Frank X. Strobl A. Polyansky B. Zagrovic A. Akalin D. Slade 01. Dezember 2018 / GigaScience PiGx: reproducible genomics analysis pipelines with GNU Guix R. Wurmus B. Uyar B. Osberg V. Franke A. Gosdschan K. Wreczycka J. Ronen A. Akalin 18. März 2019 / Nucleic Acids Res Alternative 3' UTRs direct localization of functionally diverse protein isoforms in neuronal compartments C. Ciolli Mattioli A. Rom V. Franke K. Imami G. Arrey M. Terne A. Woehler A. Akalin I. Ulitsky M. Chekulaeva 28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit 20. Juni 2019 / Nucleic Acids Res HOT or not: examining the basis of high-occupancy target regions K. Wreczycka V. Franke B. Uyar R. Wurmus S. Bulut B. Tursun A. Akalin 06. Dezember 2021 / Genome Biol The SEQC2 epigenomics quality control (EpiQC) study J. Foox J. Nordlund C. Lalancette T. Gong M. Lacey S. Lent B.W. Langhorst V.K.C. Ponnaluri L. Williams K.R. Padmanabhan R. Cavalcante A. Lundmark D. Butler C. Mozsary J. Gurvitch J.M. Greally M. Suzuki M. Menor M. Nasu A. Alonso C. Sheridan A. Scherer S. Bruinsma G. Golda A. Muszynska P.P. Łabaj M.A. Campbell F. Wos A. Raine U. Liljedahl T. Axelsson C. Wang Z. Chen Z. Yang J. Li X. Yang H. Wang A. Melnick S. Guo A. Blume V. Franke I. Ibanez de Caceres C. Rodriguez-Antolin R. Rosas J.W. Davis J. Ishii D.B. Megherbi W. Xiao W. Liao J. Xu H. Hong B. Ning W. Tong A. Akalin Y. Wang Y. Deng C.E. Mason Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Seite 3 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
01. April 2015 / Bioinformatics genomation: a toolkit to summarize, annotate and visualize genomic intervals A. Akalin V. Franke K. Vlahoviček C.E. Mason D. Schübeler
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler
19. März 2021 / iScience Transcriptomic profiling of SARS-CoV-2 infected human cell lines identifies HSP90 as target for COVID-19 therapy E. Wyler K. Mösbauer V. Franke A. Diag L.T. Gottula R. Arsiè F. Klironomos D. Koppstein K. Hönzke S. Ayoub C. Buccitelli K. Hoffmann A. Richter I. Legnini A. Ivanov T. Mari S. Del Giudice J. Papies S. Praktiknjo T.F. Meyer M.A. Müller D. Niemeyer A. Hocke M. Selbach A. Akalin N. Rajewsky C. Drosten M. Landthaler
30. November 2023 / Nat Commun The SPOC proteins DIDO3 and PHF3 co-regulate gene expression and neuronal differentiation J. Benedum V. Franke L.M. Appel L. Walch M. Bruno R. Schneeweiss J. Gruber H. Oberndorfer E. Frank X. Strobl A. Polyansky B. Zagrovic A. Akalin D. Slade
01. Dezember 2018 / GigaScience PiGx: reproducible genomics analysis pipelines with GNU Guix R. Wurmus B. Uyar B. Osberg V. Franke A. Gosdschan K. Wreczycka J. Ronen A. Akalin
18. März 2019 / Nucleic Acids Res Alternative 3' UTRs direct localization of functionally diverse protein isoforms in neuronal compartments C. Ciolli Mattioli A. Rom V. Franke K. Imami G. Arrey M. Terne A. Woehler A. Akalin I. Ulitsky M. Chekulaeva
28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit
20. Juni 2019 / Nucleic Acids Res HOT or not: examining the basis of high-occupancy target regions K. Wreczycka V. Franke B. Uyar R. Wurmus S. Bulut B. Tursun A. Akalin
06. Dezember 2021 / Genome Biol The SEQC2 epigenomics quality control (EpiQC) study J. Foox J. Nordlund C. Lalancette T. Gong M. Lacey S. Lent B.W. Langhorst V.K.C. Ponnaluri L. Williams K.R. Padmanabhan R. Cavalcante A. Lundmark D. Butler C. Mozsary J. Gurvitch J.M. Greally M. Suzuki M. Menor M. Nasu A. Alonso C. Sheridan A. Scherer S. Bruinsma G. Golda A. Muszynska P.P. Łabaj M.A. Campbell F. Wos A. Raine U. Liljedahl T. Axelsson C. Wang Z. Chen Z. Yang J. Li X. Yang H. Wang A. Melnick S. Guo A. Blume V. Franke I. Ibanez de Caceres C. Rodriguez-Antolin R. Rosas J.W. Davis J. Ishii D.B. Megherbi W. Xiao W. Liao J. Xu H. Hong B. Ning W. Tong A. Akalin Y. Wang Y. Deng C.E. Mason