Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (22) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Mathas, Stephan Dr. (3) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Advanced Light Microscopy (4) Animal Phenotyping (2) Ankerproteine und Signaltransduktion (2) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (13) Bioinformatik der Genregulation (139) Biologie maligner Lymphome (70) Entwicklung Mechanismus-basierter Krebstherapien (4) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (1) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (12) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (1) Hochschulambulanz für Pädiatrische Allergologie und Neurodermitis (1) Immundysregulationen in der Onkologie (1) Immunregulation und Krebs (3) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (19) Molekulare Genetik allergischer Erkrankungen (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (11) Molekulare Immunologie und Gentherapie (1) Molekulare Onkologie (7) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (1) Molekulare Signalwege in der kortikalen Entwicklung (2) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (2) Organoids (1) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (2) Pluripotent Stem Cells (1) Protein Production and Characterization (1) Proteom Dynamik (11) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (18) Proteomics (4) Psychoneuroimmunologie (1) Quantitative Entwicklungsbiologie (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (10) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (9) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (4) Systems Biology Imaging (1) Transgenics (1) Translational Bioinformatics (4) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (3) Translationale Tumorimmunologie (1) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (3) Zelluläre Neurowissenschaften (4) 2017 (3) 2019 (4) 2020 (1) 2022 (3) 2023 (2) 13 Ergebnisse: Active Filter: Mathas, Stephan Dr.Ohler, Uwe Prof. Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas 01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller 01. Januar 2023 / Sci Immunol A multimorphic mutation in IRF4 causes human autosomal dominant combined immunodeficiency O. Fornes A. Jia H.S. Kuehn Q. Min U. Pannicke N. Schleussner R. Thouenon Z. Yu M. de Los Angeles Astbury C.M. Biggs M. Galicchio J.A. Garcia-Campos S. Gismondi G. Gonzalez Villarreal K.J. Hildebrand M. Hönig J. Hou D. Moshous S. Pittaluga X. Qian J. Rozmus A.S. Schulz A.T. Staines-Boone B. Sun J. Sun S. Uwe E. Venegas-Montoya W. Wang X. Wang W. Ying X. Zhai Q. Zhou A. Akalin I. André T.F.E. Barth B. Baumann A. Brüstle G. Burgio J.C. Bustamante J.L. Casanova M.G. Casarotto M. Cavazzana L. Chentout I.A. Cockburn M. Costanza C. Cui O. Daumke K.L. Del Bel H. Eibel X. Feng V. Franke J.C.M. Gebhardt A. Götz S. Grunwald B. Hoareau T.R. Hughes E.M. Jacobsen M. Janz A. Jolma C. Lagresle-Peyrou N. Lai Y. Li S. Lin H.Y. Lu S.O. Lugo-Reyes X. Meng P. Möller N. Moreno-Corona J.E. Niemela G. Novakovsky J.J. Perez-Caraballo C. Picard L. Poggi M.E. Puig-Lombardi K.L. Randall A. Reisser Y. Schmitt S. Seneviratne M. Sharma J. Stoddard S. Sundararaj H. Sutton L.Q. Tran Y. Wang W.W. Wasserman Z. Wen W. Winkler E. Xiong A.W.H. Yang M. Yu L. Zhang H. Zhang Q. Zhao X. Zhen A. Enders S. Kracker R. Martinez-Barricarte S. Mathas S.D. Rosenzweig K. Schwarz S.E. Turvey J.Y. Wang 28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler 09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas
01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller
01. Januar 2023 / Sci Immunol A multimorphic mutation in IRF4 causes human autosomal dominant combined immunodeficiency O. Fornes A. Jia H.S. Kuehn Q. Min U. Pannicke N. Schleussner R. Thouenon Z. Yu M. de Los Angeles Astbury C.M. Biggs M. Galicchio J.A. Garcia-Campos S. Gismondi G. Gonzalez Villarreal K.J. Hildebrand M. Hönig J. Hou D. Moshous S. Pittaluga X. Qian J. Rozmus A.S. Schulz A.T. Staines-Boone B. Sun J. Sun S. Uwe E. Venegas-Montoya W. Wang X. Wang W. Ying X. Zhai Q. Zhou A. Akalin I. André T.F.E. Barth B. Baumann A. Brüstle G. Burgio J.C. Bustamante J.L. Casanova M.G. Casarotto M. Cavazzana L. Chentout I.A. Cockburn M. Costanza C. Cui O. Daumke K.L. Del Bel H. Eibel X. Feng V. Franke J.C.M. Gebhardt A. Götz S. Grunwald B. Hoareau T.R. Hughes E.M. Jacobsen M. Janz A. Jolma C. Lagresle-Peyrou N. Lai Y. Li S. Lin H.Y. Lu S.O. Lugo-Reyes X. Meng P. Möller N. Moreno-Corona J.E. Niemela G. Novakovsky J.J. Perez-Caraballo C. Picard L. Poggi M.E. Puig-Lombardi K.L. Randall A. Reisser Y. Schmitt S. Seneviratne M. Sharma J. Stoddard S. Sundararaj H. Sutton L.Q. Tran Y. Wang W.W. Wasserman Z. Wen W. Winkler E. Xiong A.W.H. Yang M. Yu L. Zhang H. Zhang Q. Zhao X. Zhen A. Enders S. Kracker R. Martinez-Barricarte S. Mathas S.D. Rosenzweig K. Schwarz S.E. Turvey J.Y. Wang
28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler
09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler