Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (73) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Driesner, Madlen (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (22) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (2) Kühn, Ralf Dr. (1) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (5) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (8) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rrustemi, Trendelina (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (3) Wurmus, Ricardo (9) Wyler, Emanuel Dr. (4) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) (-) Mathas, Stephan Dr. (3) (-) Mertins, Philipp Dr. (1) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Advanced Light Microscopy (1) AG Müller/Dechend (ECRC) (5) AG Schreiber [ECRC] (1) Animal Phenotyping (5) Ankerproteine und Signaltransduktion (3) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (14) Bioinformatik der Genregulation (141) Biologie maligner Lymphome (72) Clinical Research Unit (1) Electron Microscopy (3) Entwicklung Mechanismus-basierter Krebstherapien (6) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (1) Epigenetische Modifikationen in Neuroblastom (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (1) Experimentelle Ultrahochfeld-MR (1) Flow Cytometry (1) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (20) Genetik von Angeborenen Herzerkrankungen (1) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (2) Genomdiversifikation & Integrität (2) Genomics (1) Hochschulambulanz für Pädiatrische Allergologie und Neurodermitis (1) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (5) Hypertonie bedingte Endorganschäden (5) Immundysregulationen in der Onkologie (1) Immunregulation und Krebs (5) Intrazelluläre Proteolyse (1) Magnetic Resonance (1) Mathematische Zellphysiologie (2) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (5) Mobile DNA (2) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (40) Molekulare Genetik allergischer Erkrankungen (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (13) Molekulare Immunologie und Gentherapie (3) Molekulare Onkologie (7) Myologie (1) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (3) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (2) Pluripotent Stem Cells (2) Proteom Dynamik (11) Proteomics (115) Proteomics and Metabolomics (1) Psychoneuroimmunologie (5) Quantitative Entwicklungsbiologie (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (12) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (4) Synaptische Transmission und Plastitzität (1) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (6) Systems Biology Imaging (1) Transgenics (2) Translational Bioinformatics (8) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (6) Translationale Onkologie solider Tumore (4) Translationale Tumorimmunologie (3) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (4) Tumorheterogenität und Therapieresistenz in pädiatrischen Tumoren (1) Wirt-Mikrobiom Faktoren in Herz-Kreislauferkrankungen (2) Zelluläre Neurowissenschaften (7) 2017 (3) 2018 (1) 2019 (4) 2020 (1) 2022 (3) 2023 (2) 14 Ergebnisse: Active Filter: Mathas, Stephan Dr.Mertins, Philipp Dr.Ohler, Uwe Prof. Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas 01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller 01. Januar 2023 / Sci Immunol A multimorphic mutation in IRF4 causes human autosomal dominant combined immunodeficiency O. Fornes A. Jia H.S. Kuehn Q. Min U. Pannicke N. Schleussner R. Thouenon Z. Yu M. de Los Angeles Astbury C.M. Biggs M. Galicchio J.A. Garcia-Campos S. Gismondi G. Gonzalez Villarreal K.J. Hildebrand M. Hönig J. Hou D. Moshous S. Pittaluga X. Qian J. Rozmus A.S. Schulz A.T. Staines-Boone B. Sun J. Sun S. Uwe E. Venegas-Montoya W. Wang X. Wang W. Ying X. Zhai Q. Zhou A. Akalin I. André T.F.E. Barth B. Baumann A. Brüstle G. Burgio J.C. Bustamante J.L. Casanova M.G. Casarotto M. Cavazzana L. Chentout I.A. Cockburn M. Costanza C. Cui O. Daumke K.L. Del Bel H. Eibel X. Feng V. Franke J.C.M. Gebhardt A. Götz S. Grunwald B. Hoareau T.R. Hughes E.M. Jacobsen M. Janz A. Jolma C. Lagresle-Peyrou N. Lai Y. Li S. Lin H.Y. Lu S.O. Lugo-Reyes X. Meng P. Möller N. Moreno-Corona J.E. Niemela G. Novakovsky J.J. Perez-Caraballo C. Picard L. Poggi M.E. Puig-Lombardi K.L. Randall A. Reisser Y. Schmitt S. Seneviratne M. Sharma J. Stoddard S. Sundararaj H. Sutton L.Q. Tran Y. Wang W.W. Wasserman Z. Wen W. Winkler E. Xiong A.W.H. Yang M. Yu L. Zhang H. Zhang Q. Zhao X. Zhen A. Enders S. Kracker R. Martinez-Barricarte S. Mathas S.D. Rosenzweig K. Schwarz S.E. Turvey J.Y. Wang 28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler 09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler 14. Dezember 2018 / EMBO J The IκB kinase complex is a regulator of mRNA stability N. Mikuda M. Kolesnichenko P. Beaudette O. Popp B. Uyar W. Sun A.B. Tufan B. Perder A. Akalin W. Chen P. Mertins G. Dittmar M. Hinz C. Scheidereit Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
01. Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
07. November 2023 / Nat Commun Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma N. Schleussner P. Cauchy V. Franke M. Giefing O. Fornes N. Vankadari S.A. Assi M. Costanza M.A. Weniger A. Akalin I. Anagnostopoulos T. Bukur M.G. Casarotto F. Damm O. Daumke B. Edginton-White J.C.M. Gebhardt M. Grau S. Grunwald M.L. Hansmann S. Hartmann L. Huber E. Kärgel S. Lusatis D. Noerenberg N. Obier U. Pannicke A. Fischer A. Reisser A. Rosenwald K. Schwarz S. Sundararaj A. Weilemann W. Winkler W. Xu G. Lenz K. Rajewsky W.W. Wasserman P.N. Cockerill C. Scheidereit R. Siebert R. Küppers R. Grosschedl M. Janz C. Bonifer S. Mathas
01. Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller
01. Januar 2023 / Sci Immunol A multimorphic mutation in IRF4 causes human autosomal dominant combined immunodeficiency O. Fornes A. Jia H.S. Kuehn Q. Min U. Pannicke N. Schleussner R. Thouenon Z. Yu M. de Los Angeles Astbury C.M. Biggs M. Galicchio J.A. Garcia-Campos S. Gismondi G. Gonzalez Villarreal K.J. Hildebrand M. Hönig J. Hou D. Moshous S. Pittaluga X. Qian J. Rozmus A.S. Schulz A.T. Staines-Boone B. Sun J. Sun S. Uwe E. Venegas-Montoya W. Wang X. Wang W. Ying X. Zhai Q. Zhou A. Akalin I. André T.F.E. Barth B. Baumann A. Brüstle G. Burgio J.C. Bustamante J.L. Casanova M.G. Casarotto M. Cavazzana L. Chentout I.A. Cockburn M. Costanza C. Cui O. Daumke K.L. Del Bel H. Eibel X. Feng V. Franke J.C.M. Gebhardt A. Götz S. Grunwald B. Hoareau T.R. Hughes E.M. Jacobsen M. Janz A. Jolma C. Lagresle-Peyrou N. Lai Y. Li S. Lin H.Y. Lu S.O. Lugo-Reyes X. Meng P. Möller N. Moreno-Corona J.E. Niemela G. Novakovsky J.J. Perez-Caraballo C. Picard L. Poggi M.E. Puig-Lombardi K.L. Randall A. Reisser Y. Schmitt S. Seneviratne M. Sharma J. Stoddard S. Sundararaj H. Sutton L.Q. Tran Y. Wang W.W. Wasserman Z. Wen W. Winkler E. Xiong A.W.H. Yang M. Yu L. Zhang H. Zhang Q. Zhao X. Zhen A. Enders S. Kracker R. Martinez-Barricarte S. Mathas S.D. Rosenzweig K. Schwarz S.E. Turvey J.Y. Wang
28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler
09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler
14. Dezember 2018 / EMBO J The IκB kinase complex is a regulator of mRNA stability N. Mikuda M. Kolesnichenko P. Beaudette O. Popp B. Uyar W. Sun A.B. Tufan B. Perder A. Akalin W. Chen P. Mertins G. Dittmar M. Hinz C. Scheidereit