Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Acevedo Ochoa, Ernesto (1) Akalin, Altuna Dr. (75) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (2) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Bauersachs, Daniel (1) Berruezo Llacuna, Maria (2) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (6) Blankenstein, Thomas Prof. Dr. (1) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Cerda Jara, Cledi Alicia (2) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (15) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Dang Ngoc, Tu Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) de la Rosa, Kathrin Prof. Dr. (3) Del Giudice, Simone (1) del Rey Mateos, Sara Adelaida (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (5) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (3) Driesner, Madlen (1) Emmenegger, Lisa (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (2) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (23) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Gotthardt, Michael Prof. Dr. (1) Graf, Robin Dr. (8) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Jedamzick, Johanna Verena (1) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Jüttner, Rene Dr. (1) Kammertöns, Thomas Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (2) Kettenmann, Helmut Prof. Dr. (1) Kieshauer, Janine (1) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kocks, Christine Dr. (8) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (148) Kukalev, Alexander Dr. (2) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Lahmann, Ines Dr. (1) Landthaler, Markus Prof. Dr. (6) Lebedin, Mikhail (4) Lewin, Gary Prof. Dr. (1) Lisowski, Pawel Dr. (4) Lohse, Martin Prof. Dr. (2) Lupianez Garcia, Dario Jesus Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mastrobuoni, Guido Dr. (1) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (3) Metzger, Jakob Johannes Dr. (1) Monti, Remo (1) Müller, Thomas Dr. (1) Müthel, Stefanie (4) Neuendorf, Nancy (1) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Oliveras Martinez, Anna Dr. (1) Otto, Maximilian (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pempe, Jenniffer (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (3) Preibisch, Stephan Dr. (2) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (3) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (38) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (13) Rathgeber, Anja (1) Rathjen, Fritz Prof. Dr. (1) Rehm, Armin Dr. (1) Richter, Matthias (1) Roman, Alexandra (1) Roske, Yvette Dr. (1) Roth, Philipp (1) Roßius, Jana (4) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Rybak-Wolf, Agnieszka Dr. (4) Salomon, Claudia (2) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Schütz, Anja Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Semtner, Marcus Dr. (1) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Sporbert, Anje Dr. (2) Spuler, Simone Prof. (4) Szabo, Dominik (1) Telugu, Narasimha Swamy Dr. (2) Thieme, Christoph Dr. (1) Trombke, Janine (2) Tursun, Baris Dr. (4) Ugursu Isyar, Bilge (1) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Wanker, Erich Prof. Dr. (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (5) Wolf, Jana Prof. Dr. (1) Wolf, Susanne Dr. (1) Wurmus, Ricardo (10) Wyler, Emanuel Dr. (5) Xiong, Ermeng Dr. (1) Zach, Andreas (1) Zampieri, Niccolo Dr. (2) Zauber, Henrik Dr. (2) Zea Redondo, Luna (1) Zinzen, Robert Patrick Dr. (1) Zywitza, Vera Dr. (1) (-) Mathas, Stephan Dr. (3) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) AG Müller/Dechend (ECRC) (5) Animal Phenotyping (4) Ankerproteine und Signaltransduktion (2) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (13) Bioinformatik der Genregulation (146) Biologie maligner Lymphome (71) Chemical Biology (3) Clinical Research Unit (1) Electron Microscopy (1) Entwicklung Mechanismus-basierter Krebstherapien (4) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (1) Experimentelle Ultrahochfeld-MR (1) Genetik und Genomik von 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September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler 28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler 09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler
28. März 2019 / Blood Autocrine LTA signaling drives NF-κB and JAK-STAT activity and myeloid gene expression in Hodgkin lymphoma L. von Hoff E. Kärgel V. Franke E. McShane K.W. Schulz-Beiss G. Patone N. Schleussner M. Kolesnichenko N. Hübner O. Daumke M. Selbach A. Akalin S. Mathas C. Scheidereit
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler
09. April 2019 / Nat Commun Global identification of functional microRNA-mRNA interactions in Drosophila H.H. Wessels S. Lebedeva A. Hirsekorn R. Wurmus A. Akalin N. Mukherjee U. Ohler