Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Adami, Eleonora Dr. (3) Altmueller, Janine Dr.med. (4) Bader, Michael Prof. Dr. (1) Barke, Niclas (1) Bernert, Carola (1) Beule, Dieter Dr. (9) Birchmeier, Walter Prof. Dr. (23) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (175) Blachut, Susanne (1) Blume, Alexander Dr. (1) Blüthgen, Nils (7) Borodina, Tatiana Dr. (3) Brüning, Ulrike Dr. (2) Cerda Jara, Cledi Alicia (1) Chekulaeva, Marina Dr. (4) Chen, Chia-Yu (1) Chen, Wei Prof. Dr. (6) Chu, Van Trung Dr. (1) Daumke, Oliver Prof. Dr. (2) de la Rosa, Kathrin Prof. Dr. (1) Del Giudice, Simone (2) Deter, Aylina (2) Diecke, Sebastian Dr. (3) Escobar Fernandez, Helena Dr. (2) Essex, Morgan (2) Falcke, Martin Prof. Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Fielitz, Jens Dr. (2) Fischer, Cornelius Dr. (2) Forslund, Sofia Dr. (2) Franke, Vedran Dr. (8) Freimuth, Jonas (1) Fritsche, Raphaela Dr. (3) Gargiulo, Gaetano Dr. (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (5) Gil, Marine (1) Golusik, Sabrina (1) Gotthardt, Michael Prof. Dr. (3) Gouti, Mina Dr. (1) Graf, Robin Dr. (1) Griffel, Carola (2) Grobe, Jenny (1) Grossmann, Katja Dr. (2) Grosswendt, Stefanie Dr. (1) Haghverdi, Laleh Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (2) Heinemann, Udo Prof. Dr. (4) Henssen, Anton Prof. Dr. med. (1) Herzog, Margareta (1) Hinz, Michael Dr. (1) Hinze, Christian Dr. med. Dipl.-Math. (2) Hirsekorn, Antje (12) Hübner, Norbert Prof. Dr. (8) Hummel, Oliver (1) Huryn, Viktoriia (1) Izsvak, Zsuzsanna Dr. (1) Jung, Simone (1) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (2) Jüttner, Rene Dr. (3) Kastelic, Nicolai (5) Kaufmann, Tom (2) Kempa, Stefan Dr. (9) Kettenmann, Helmut Prof. Dr. (1) Kieshauer, Janine (1) Kirchner, Marieluise Dr. (4) Kirwan, Jennifer Dr. (2) Kocks, Christine Dr. (10) Kühn, Ralf Dr. (4) Kunz, Severine Dr. (5) Lacadie, Scott Allen Dr. (10) Lahmann, Ines Dr. (11) Landthaler, Markus Prof. Dr. (131) Lebedin, Mikhail (1) Lewin, Gary Prof. Dr. (7) Lindberg, Eric Lars-Helge (1) Löber, Ulrike Dr. (2) Luft, Friedrich Prof. Dr. (1) Maatz, Henrike Dr. (3) Manukyan, Artür Dr. (1) Marg, Andreas Dr. (2) Marko, Lajos Dr. (2) Mastrobuoni, Guido Dr. (8) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (2) Minia, Igor Dr. (5) Mintcheva, Janita (1) Monti, Remo (6) Müller, Dominik Prof. Dr. (2) Müller, Thomas Dr. (23) Müthel, Stefanie (1) Nazare, Marc (1) Neuschulz, Anika (1) Obermayer-Wasserscheid, Benedikt Dr. (13) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Ohler, Uwe Prof. Dr. (145) Oliveras Martinez, Anna Dr. (2) Panakova, Daniela Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Paul, Friedemann Prof. Dr. med. (1) Pilz, Bernhard Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (1) Poulet, James Prof. Dr. (3) Preibisch, Stephan Dr. (2) Quedenau, Claudia (4) Radke, Michael Dr. (1) Rahn, Hans-Peter Dr. (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (3) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (29) Rathjen, Fritz Prof. Dr. (2) Rautenstrauch, Pia Josefine (3) Röefzaad, Claudia (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Ruiz Orera, Jorge Dr. (1) Rybak-Wolf, Agnieszka Dr. (6) Sander, Maike Prof. Dr. (1) Scharek, Nadine (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Schütz, Anja Dr. (3) Schwarz, Roland Dr. (4) Selbach, Matthias Prof. Dr. (26) Sohn, Madlen (1) Spagnoli, Francesca Dr. (1) Sprink, Thiemo Dr. (1) Spuler, Simone Prof. (6) Streck, Adam Dr. (1) Teixeira Alves, Luiz Gustavo Dr. (10) Todiras, Mihail (1) Treier, Mathias Prof. Dr. (4) Villamil, Gabriel (1) Vitcetz, Sarah Nathalie (1) Wanker, Erich Prof. Dr. (2) Wei, Tzu Ting (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Wisinski-Bokiniec, Phillip Dr. (2) Woehler, Andrew Dr. (6) Wolf, Jana Prof. Dr. (4) Wolf, Susanne Dr. (1) Wurmus, Ricardo (5) Wyler, Emanuel Dr. (66) Zach, Andreas (1) Zampieri, Niccolo Dr. (4) Zauber, Henrik Dr. (5) Zenkner, Martina (1) Zinzen, Robert Patrick Dr. (4) Zywitza, Vera Dr. (1) (-) Akalin, Altuna Dr. (18) (-) Tursun, Baris Dr. (2) (-) Uyar, Bora Dr. (4) (-) Vucicevic, Dubravka (3) AG Müller/Dechend (ECRC) (11) Animal Phenotyping (3) Bioinformatics and Omics Data Science (76) (-) Bioinformatik der Genregulation (11) Biologie maligner Lymphome (4) Chemical Biology (1) (-) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (4) Entwicklung und Funktion neuraler Netzwerke (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (4) Experimentelle Ultrahochfeld-MR (28) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (6) Genetik von Angeborenen Herzerkrankungen (1) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (9) Genomdiversifikation & Integrität (2) Genomics (1) Hypertonie-vermittelter Endorganschaden (11) Hypertonie bedingte Endorganschäden (11) Immunmechanismen und humane Antikörper (2) Immunregulation und Krebs (11) Integrative Vaskuläre Biologie (1) Kardiale MRT (37) Magnetic Resonance (28) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (2) Mobile DNA (1) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (8) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (3) Myologie (6) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (1) Neuroimmunologie-Labor (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (4) Pluripotent Stem Cells (2) Proteom Dynamik (6) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (2) Proteomics (4) Proteomics and Metabolomics (2) Quantitative Entwicklungsbiologie (1) (-) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (6) Screening Unit (1) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (4) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (8) Systems Biology Imaging (2) Transgenics (9) Translational Bioinformatics (1) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (1) Translationale Tumorimmunologie (1) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (1) 2015 (1) 2016 (1) 2017 (4) 2018 (3) 2019 (4) 2020 (2) 2021 (2) 2022 (3) 20 Ergebnisse: Active Filter: Akalin, Altuna Dr.Tursun, Baris Dr.Uyar, Bora Dr.Vucicevic, DubravkaBioinformatik der GenregulationEntwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 07. Juni 2016 / Oncotarget The long non-coding RNA PARROT is an upstream regulator of c-Myc and affects proliferation and translation D. Vučićević M. Gehre S. Dhamija L. Friis-Hansen D. Meierhofer S. Sauer U.A. Ørom 19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva 31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier 20. Dezember 2022 / Sci Total Environ SARS-CoV-2 infection dynamics revealed by wastewater sequencing analysis and deconvolution V.F. Schumann R.R. de Castro Cuadrat E. Wyler R. Wurmus A. Deter C. Quedenau J. Dohmen M. Faxel T. Borodina A. Blume J. Freimuth M. Meixner J.H. Grau K. Liere T. Hackenbeck F. Zietzschmann R. Gnirss U. Böckelmann B. Uyar V. Franke N. Barke J. Altmüller N. Rajewsky M. Landthaler A. Akalin Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler 13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. 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07. Juni 2016 / Oncotarget The long non-coding RNA PARROT is an upstream regulator of c-Myc and affects proliferation and translation D. Vučićević M. Gehre S. Dhamija L. Friis-Hansen D. Meierhofer S. Sauer U.A. Ørom
19. September 2017 / Nat Commun RNA localization is a key determinant of neurite-enriched proteome A. Zappulo D. van den Bruck C. Ciolli Mattioli V. Franke K. Imami E. McShane M. Moreno-Estelles L. Calviello A. Filipchyk E. Peguero-Sanchez T. Müller A. Woehler C. Birchmeier E. Merino N. Rajewsky U. Ohler E.O. Mazzoni M. Selbach A. Akalin M. Chekulaeva
31. Oktober 2017 / Genome Biol Widespread activation of antisense transcription of the host genome during herpes simplex virus 1 infection E. Wyler J. Menegatti V. Franke C. Kocks A. Boltengagen T. Hennig K. Theil A. Rutkowski C. Ferrai L. Baer L. Kermas C. Friedel N. Rajewsky A. Akalin L. Dölken F. Grässer M. Landthaler
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier
20. Dezember 2022 / Sci Total Environ SARS-CoV-2 infection dynamics revealed by wastewater sequencing analysis and deconvolution V.F. Schumann R.R. de Castro Cuadrat E. Wyler R. Wurmus A. Deter C. Quedenau J. Dohmen M. Faxel T. Borodina A. Blume J. Freimuth M. Meixner J.H. Grau K. Liere T. Hackenbeck F. Zietzschmann R. Gnirss U. Böckelmann B. Uyar V. Franke N. Barke J. Altmüller N. Rajewsky M. Landthaler A. Akalin
Februar 2022 / Nat Mach Intell Simultaneous dimensionality reduction and integration for single-cell ATAC-seq data using deep learning W. Kopp A. Akalin U. Ohler
13. Januar 2022 / Cell Genom Single-cell-resolved dynamics of chromatin architecture delineate cell and regulatory states in zebrafish embryos A.C. McGarvey W. Kopp D. Vučićević K. Mattonet R. Kempfer A. Hirsekorn I. Bilić M. Gil A. Trinks A.M. Merks D. Panáková A. Pombo A. Akalin J.P. Junker D.Y.R. Stainier D. Garfield U. Ohler S.A. Lacadie