Wissenschaftliche Publikationen Suche Suche Autor/in Forschungsgruppe Veröffentlichungsdatum Wirkungsfaktor Suchen Sortieren nach RelevanceFrom A-ZAuthored onDate/Time RangeRelease date Reihenfolge AufsteigendAbsteigend Akalin, Altuna Dr. (75) Altmueller, Janine Dr.med. (1) Annibale, Paolo Dr. (1) Bahry, Ella Dr. (1) Barke, Niclas (1) Berruezo Llacuna, Maria (1) Birchmeier-Kohler, Carmen Prof. Dr. (3) Blume, Alexander Dr. (6) Borodina, Tatiana Dr. (1) Carvalho, Silvia Filipa (1) Cerda Jara, Cledi Alicia (1) Chekulaeva, Marina Dr. (2) Chen, Wei Prof. Dr. (1) Chu, Van Trung Dr. (1) Costanza, Mariantonia Dr. (2) Daumke, Oliver Prof. Dr. (4) Del Giudice, Simone (1) Deter, Aylina (1) Diecke, Sebastian Dr. (2) Di Virgilio, Michela Prof. Dr. (2) Emmenegger, Lisa (1) Escobar Fernandez, Helena Dr. (1) Faxel, Miriam (1) Franke, Vedran Dr. (23) Freimuth, Jonas (1) Gerhardt, Holger Prof. Dr. (1) Ghanbari, Mahsa Dr. (1) Gil, Marine (1) Graf, Robin Dr. (1) Harabula, Izabela-Cezara (1) Haucke, Volker Professor (1) Hinz, Michael Dr. (2) Hirsekorn, Antje (4) Hübner, Norbert Prof. Dr. (1) Irastorza Azcarate, Ibai Dr. (1) Janz, Martin Dr. (3) Junker, Jan Philipp Prof. Dr. (1) Keller, Lisa (1) Kempa, Stefan Dr. (2) Kirchner, Marieluise Dr. (1) Kolesnichenko, Marina Dr. (3) Kühn, Ralf Dr. (1) Lacadie, Scott Allen Dr. (3) Landthaler, Markus Prof. Dr. (6) Lohse, Martin Prof. Dr. (1) Lusatis, Simone (1) Marg, Andreas Dr. (1) Mastrobuoni, Guido Dr. (1) Mathas, Stephan Dr. (3) Meijer, Mandy Dr. (1) Merks, Anne Margarete Dr. (1) Mertins, Philipp Dr. (1) Monti, Remo (1) Müthel, Stefanie (3) Ofenbauer, Andreas Dr. (1) Oliveras Martinez, Anna Dr. (1) Panakova, Daniela Dr. (1) Patarcic, Inga Dr. (1) Patone, Giannino Dr. (1) Pombo, Ana Prof. Dr. (3) Popp, Oliver Dr. (1) Preibisch, Stephan Dr. (1) Prigione, Alessandro Prof. Dr. (1) Quedenau, Claudia (1) Rajewsky, Klaus Prof. Dr. (2) Rajewsky, Nikolaus Prof. Dr. (9) Rathgeber, Anja (1) Rehm, Armin Dr. (1) Roske, Yvette Dr. (1) Rudolph, Ina-Maria Dr. (1) Rybak-Wolf, Agnieszka Dr. (1) Scheidereit, Claus Prof. Dr. (4) Schmidt-Ullrich, Ruth Dr. (1) Schmitt, Clemens Prof. Dr. (1) Selbach, Matthias Prof. Dr. (5) Serebreni, Leonid Dr. (1) Siffrin, Volker (1) Spuler, Simone Prof. (2) Szabo, Dominik (1) Thieme, Christoph Dr. (1) Tursun, Baris Dr. (4) Uyar, Bora Dr. (15) Vucicevic, Dubravka (2) Willimsky, Gerald Dr. (1) Willnow, Thomas Prof. Dr. (1) Winick-Ng, Warren Dr. (1) Woehler, Andrew Dr. (4) Wurmus, Ricardo (10) Wyler, Emanuel Dr. (5) Zampieri, Niccolo Dr. (1) Zauber, Henrik Dr. (1) Zea Redondo, Luna (1) Zinzen, Robert Patrick Dr. (1) (-) Driesner, Madlen (1) (-) Herzog, Margareta (1) (-) Höpken, Uta Elisabeth PD Dr. (2) (-) Kocks, Christine Dr. (2) (-) Kukalev, Alexander Dr. (2) (-) Müller, Thomas Dr. (1) (-) Ohler, Uwe Prof. Dr. (10) Advanced Light Microscopy (1) AG Schreiber [ECRC] (1) Animal Phenotyping (1) Berechnungsmethoden und omic Analytik (1) (-) Bioinformatics and Omics Data Science (18) Bioinformatik der Genregulation (145) Biologie maligner Lymphome (4) Chemical Biology (1) Entwicklung Mechanismus-basierter Krebstherapien (1) Entwicklungsbiologie / Signaltransduktion in Nerven und Muskelzellen (28) Entwicklungsneurobiologie (1) Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur (10) Genetik metabolischer und reproduktiver Störungen (3) Genetik und Genomik von Herz- Kreislauferkrankungen (11) Genom-Editierung & Krankheitsmodelle (6) Genomdiversifikation & Integrität (2) Genomics (3) Immunmechanismen und humane Antikörper (2) Immunregulation und Krebs (7) Integrative Vaskuläre Biologie (1) Mathematische Modellierung zellulärer Prozesse (2) Mathematische Zellphysiologie (1) Mikroumgebung als Regulator bei Autoimmunität und Krebs (81) Molekularbiologie von Hormonen im Herz-Kreislaufssystem (1) Molekulare Herz- Kreislaufforschung (2) Molekulare Immunologie und Gentherapie (2) Molekulare Physiologie der somatosensorischen Wahrnehmung (2) Myologie (1) Nephrologie und entzündliche Gefäßerkrankungen (2) Neuroimmunologie-Labor (1) Neuronale Schaltkreise und Verhalten (1) Nicht-Kodierende RNAs und Mechanismen der Genregulation im Cytoplasma (1) Pancreatic Organoid Research and Disease Modeling (1) Pluripotent Stem Cells (2) Proteom Dynamik (10) Proteomforschung und molekulare Mechanismen bei neurodegenerativen Erkrankungen (1) Proteomics (3) Proteomics and Metabolomics (1) Psychoneuroimmunologie (1) Quantitative Entwicklungsbiologie (3) RNA Biologie und Posttranscriptionale Regulation (18) Screening Unit (1) Strukturbiologie Membran-assoziierter Prozesse (1) Systembiologie von Gen-regulatorischen Elementen (29) Systems Biology Imaging (1) Transgenics (6) Translational Bioinformatics (6) Translationale Kardiologie und Funktionelle Genomforschung (2) Translationale Tumorimmunologie (26) Tumorgenetik und zelluläre Stressantworten (1) Zellzustände und ihre Funktionsweisen (3) 2017 (5) 2019 (4) 2020 (2) 2021 (4) 2022 (3) 18 Ergebnisse: Active Filter: Driesner, MadlenHerzog, MargaretaHöpken, Uta Elisabeth PD Dr.Kocks, Christine Dr.Kukalev, Alexander Dr.Müller, Thomas Dr.Ohler, Uwe Prof. Dr.Bioinformatics and Omics Data Science Sortieren: Treffgenauigkeit Neueste nach älteste Älteste nach neueste 02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin 03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen 05. Oktober 2020 / J Exp Med PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification V. Delgado-Benito M. Berruezo-Llacuna R. Altwasser W. Winkler D. Sundaravinayagam S. Balasubramanian M. Caganova R. Graf A. Rahjouei M.T. Henke M. Driesner L. Keller A. Prigione M. Janz A. Akalin M. Di Virgilio 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler 15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit 26. Oktober 2021 / Cell Rep Lymphocyte access to lymphoma is impaired by high endothelial venule regression L. Menzel M. Zschummel T. Crowley V. Franke M. Grau C. Ulbricht A. Hauser V. Siffrin M. Bajénoff S.E. Acton A. Akalin G. Lenz G. Willimsky U.E. Höpken A. Rehm 25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller 21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler Seitennummerierung Aktuelle Seite 1 Seite 2 Nächste Seite Next › Letzte Seite Last »
02. Juni 2017 / Nucleic Acids Res RCAS: an RNA centric annotation system for transcriptome-wide regions of interest B. Uyar D. Yusuf R. Wurmus N. Rajewsky U. Ohler A. Akalin
03. Juli 2017 / Nucleic Acids Res The RNA workbench: best practices for RNA and high-throughput sequencing bioinformatics in Galaxy B.A. Grüning J. Fallmann D. Yusuf S. Will A. Erxleben F. Eggenhofer T. Houwaart B. Batut P. Videm A. Bagnacani M. Wolfien S.C. Lott Y. Hoogstrate W.R. Hess O. Wolkenhauer S. Hoffmann A. Akalin U. Ohler P.F. Stadler R. Backofen
05. Oktober 2020 / J Exp Med PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification V. Delgado-Benito M. Berruezo-Llacuna R. Altwasser W. Winkler D. Sundaravinayagam S. Balasubramanian M. Caganova R. Graf A. Rahjouei M.T. Henke M. Driesner L. Keller A. Prigione M. Janz A. Akalin M. Di Virgilio
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
25. Januar 2019 / Nucleic Acids Res Deciphering human ribonucleoprotein regulatory networks N. Mukherjee H.H. Wessels S. Lebedeva M. Sajek M. Ghanbari A. Garzia A. Munteanu D. Yusuf T. Farazi J.I. Hoell K.M. Akat A. Akalin T. Tuschl U. Ohler
15. März 2021 / EMBO J Transcriptional repression of NFKBIA triggers constitutive IKK- and proteasome-independent p65/RelA activation in senescence M. Kolesnichenko N. Mikuda U.E. Höpken E. Kärgel B. Uyar A.B. Tufan M. Milanovic W. Sun I. Krahn K. Schleich L. von Hoff M. Hinz M. Willenbrock S. Jungmann A. Akalin S. Lee R. Schmidt-Ullrich C.A. Schmitt C. Scheidereit
26. Oktober 2021 / Cell Rep Lymphocyte access to lymphoma is impaired by high endothelial venule regression L. Menzel M. Zschummel T. Crowley V. Franke M. Grau C. Ulbricht A. Hauser V. Siffrin M. Bajénoff S.E. Acton A. Akalin G. Lenz G. Willimsky U.E. Höpken A. Rehm
25. November 2021 / Nature Cell-type specialization is encoded by specific chromatin topologies W. Winick-Ng A. Kukalev I. Harabula L. Zea-Redondo D. Szabó M. Meijer L. Serebreni Y. Zhang S. Bianco A.M. Chiariello I. Irastorza-Azcarate C.J. Thieme T.M. Sparks S. Carvalho L. Fiorillo F. Musella E. Irani E.T. Triglia A.A. Kolodziejczyk A. Abentung G. Apostolova E.J. Paul V. Franke R. Kempfer A. Akalin S.A. Teichmann G. Dechant M.A. Ungless M. Nicodemi L. Welch G. Castelo-Branco A. Pombo
Juli 2022 / Nat Genet Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements D. Baranasic M. Hörtenhuber P.J. Balwierz T. Zehnder A.K. Mukarram C. Nepal C. Várnai Y. Hadzhiev A. Jimenez-Gonzalez N. Li J. Wragg F.M. D'Orazio D. Relic M. Pachkov N. Díaz B. Hernández-Rodríguez Z. Chen M. Stoiber M. Dong I. Stevens S.E. Ross A. Eagle R. Martin O. Obasaju S. Rastegar A.C. McGarvey W. Kopp E. Chambers D. Wang H.R. Kim R.D. Acemel S. Naranjo M. Łapiński V. Chong S. Mathavan B. Peers T. Sauka-Spengler M. Vingron P. Carninci U. Ohler S.A. Lacadie S.M. Burgess C. Winata F. van Eeden J.M. Vaquerizas J.L. Gómez-Skarmeta D. Onichtchouk B.J. Brown O. Bogdanovic E. van Nimwegen M. Westerfield F.C Wardle C.O. Daub B. Lenhard F. Müller
21. Februar 2019 / Genome Biol Reproducible inference of transcription factor footprints in ATAC-seq and DNase-seq datasets using protocol-specific bias modeling A. Karabacak Calviello A. Hirsekorn R. Wurmus D. Yusuf U. Ohler