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Bundeskanzlerin Angela Merkel startet neuesten Sequenzierer im MDC

Neue Potentiale für die Medizinische Systembiologie

Bundeskanzlerin Angela Merkel hat am Dienstag, den 13. September 2011, im Berliner Institut für Medizinische Systembiologie (BIMSB) des Max-Delbrück-Centrums für Molekulare Medizin (MDC) Berlin-Buch den Startknopf für eines der neuesten Sequenziergeräte für DNA-Analysen gedrückt. Das BIMSB ist die erste akademische Forschungseinrichtung auf dem europäischen Kontinent, die diese Sequenziermaschine für die Forschung nutzt. Mit dem Gerät von Pacific Biosciences ist es möglich, einzelne DNA-Moleküle in Echtzeit zu sequenzieren und einen tieferen Einblick in die Genregulation zu gewinnen. Der aus Berlin stammende Miterfinder dieser Technologie, Dr. Jonas Korlach, war bei der Einweihung dabei. Das Sanger Institut des Wellcome Trust in Großbritannien ist die andere akademische Forschungseinrichtung in Europa, die über dieses System verfügt.

Das MDC erforscht die Entstehung von Krankheiten im
Zellinnern, an den Genen und Proteinen. Die medizinische Systembiologie
ermöglicht es mit Hilfe hochmoderner Techniken einen genauen Einblick in die
molekularen Netzwerke der Gene und Proteine zu nehmen und ihre Regulation und
ihr Zusammenspiel sowie ihre Bedeutung bei der Entstehung von Krankheiten zu
erforschen. „Dabei fallen Datenmengen in einer Dimension an, die früher nur in
der Kern- oder Astrophysik bearbeitet werden mussten. Diese Datenflut wird mit
Hilfe der Mathematik und Informatik und leistungsstarken Rechnern ausgewertet“,
erläuterte Prof. Nikolaus Rajewsky der Bundeskanzlerin, der wie Angela Merkel
ursprünglich aus der Physik kommt.

Das neue Gerät (PacBio RS System), das Pacific Biosciences,
ein Technologieunternehmen in Menlo Park, Kalifornien, USA, im April dieses
Jahres auf den Markt gebracht hat, ergänzt die Technologien in der Genomikplattform
des BIMSB, die von Dr. Wei Chen geleitetet wird. Der neuartige Sequenzierer
liest die Abfolge (Sequenz) der DNA-Bausteine (Basen) in Echtzeit, und macht
die Reaktion eines einzelnen Enzyms mit einem einzelnen DNA-Molekül mit Hilfe
eines Lasers sichtbar. Dadurch ist es nicht mehr nötig, die DNA vor der
Sequenzierung zu vermehren. Gleichzeitig können damit Fehlerquellen vermieden
werden. Die neue SMRT-Technologie (Abkürzung für single molecule real-time) kann
im Schnitt mehr als 1 000 Basen lesen und ein Experiment in einem Tag
abschließen, das zuvor eine Woche oder länger dauerte.

„Herausragend bei der SMRT-Technologie ist nicht nur, dass
man zuschauen kann, wie die DNA synthetisiert wird. Die Daten, die wir durch
diese neue Technologie generieren versetzen uns in die Lage, Genregulation, RNA-Funktion,
epigenetische Genregulation, DNA-Modifizierung und Genomstruktur quantitativ zu
analysieren. Die Technologie erlaubt uns einen tieferen Einblick in genregulatorische
Netzwerke und eröffnet uns damit einen neuen Zugang zur personalisierten
Medizin“, sagte Prof. Rajewsky.

Das BIMSB wurde 2008 vom MDC mit einer Pilotfinanzierung des
Bundesforschungsministeriums und des Senats von Berlin auf dem Campus
Berlin-Buch gegründet. Es arbeitet eng mit Forschungseinrichtungen zusammen,
insbesondere mit der Humboldt-Universität zu Berlin und der Charité –
Universitätsmedizin Berlin sowie mit der New York University in den USA. Bis
2015 wird es einen 5 500 Quadratmeter umfassenden Neubau für rund 300
Mitarbeiter auf dem Campus Nord der Humboldt-Universität erhalten, den der
Senat von Berlin mit rund 30 Millionen Euro finanziert. Die laufenden Kosten
von jährlich rund 20 Millionen Euro werden zu 90 Prozent vom Bundesforschungsministerium
und zu zehn Prozent vom Land Berlin getragen.

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Bundeskanzlerin Angela Merkel startet im Berliner Institut für Medizinische Systembiologie (BIMSB) des Max-Delbrück-Centrums für Molekulare Medizin (MDC) eines der neuesten Sequenziergeräte für DNA-Analysen. Es schauen zu: Dr. Jonas Korlach, Mitentwickler des DNA-Analysegeräts von Pacific Biosciences (r.) und Dr. Wei Chen (vorne), Leiter der Genomikplattform des BIMSB. Korlach ist auch Mitbegründer des Technologieunternehmens in Kalifornien. Im Hintergrund: Bundesforschungsministerin Annette Schavan und Prof. Nikolaus Rajewsky (l.), wissenschaftlicher Leiter des BIMSB. (Photo: David Ausserhofer/Copyright: MDC)

Bundeskanzlerin Angela Merkel lässt sich im Berliner Institut für Medizinische Systembiologie (BIMSB) des Max-Delbrück-Centrums für Molekulare Medizin (MDC) eines der neuesten Sequenziergeräte für DNA-Analysen erklären von dem aus Berlin stammenden Dr. Jonas Korlach (r.), Mitentwickler des DNA-Analysegeräts des US-Technologieunternehmens Pacific Biosciences und Dr. Wei Chen (l.), Leiter der Genomikplattform des BIMSB. Korlach ist auch Mitbegründer des Unternehmens in Menlo Park Kalifornien. (Photo: David Ausserhofer/Copyright: MDC)

Barbara Bachtler

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