Single-Cell-Ansätze für die personalisierte Medizin

Um die hoch-innovativen Einzelzellansätze so rasch wie möglich für eine effektive Translation klinisch nutzbar zu machen, begründet das BIH eine gemeinsam getragene, enge interdisziplinäre Kooperation, in welche BIH und Charité kliniknahe Expertisen (Bioinformatik, Bildgebung, Maschinelles Lernen, Onkologie, Neurologie, Dermatologie, Biobanken, Diagnostik und Biomarker) und das MDC-Mitte (BIMSB) technologische und wissenschaftliche Expertise auf dem Gebiet der Einzelzellbiologie und Genregulation einbringen.

Die Umsetzung stützt sich auf zwei Säulen:

Die Etablierung von vier Brücken-Nachwuchsgruppen von BIH, MDC-Mitte (BIMSB) und Charité, welche Einzelzellexpertise in die klinische Anwendung bringen. Diese Nachwuchsgruppen werden im BIMSB-Gebäude angesiedelt, haben dort Zugang zu den neuesten Single-Cell-Ansätze und stehen im engen Austausch mit international führenden Wissenschaftler*innen. Gleichzeitig sind diese Gruppen in jeweils eine Klinik in der Charité integriert, mit der sie klinisch relevante Themen identifizieren, Single-Cell-Ansätze nutzen und entwickeln, um konkrete klinische Fragestellungen zu bearbeiten und die Technologien für die klinische Nutzung zu etablieren. Dieses Brückenkonzept verknüpft in optimaler Weise die international führende Position des BIMSB in der Entwicklung von Single-Cell-Ansätzen mit dem klinisch-translationalen Potential von BIH/Charité.

Den Aufbau einer „Clinical Single Cell Sequencing“ Pipeline, welche ein zentrales Bioportal (Patientenprobengewinnung, -charakterisierung und -verarbeitung) sowie einen integrierten Workflow mit relevanten Genomik- und Bioinformatik-Services für die teilnehmenden Kliniken beinhaltet.
 

Single-Cell Forschungsgruppen

 

AG Haas

Systemische Hämatologie, Stammzellen & Präzisionsmedizin

AG Ludwig

Stammzelldynamiken und Mitochondriale Genomik

 

Steuerungskomitee

 

Sprecher

Prof. Dr. Nikolaus Rajewsky

87: Timoféeff-Ressovsky-Haus

Raum: 1.09

rajewsky@mdc-berlin.de

+49 30 9406-2999

Stellvertretende Sprecherin

Prof. Dr. Angelika Eggert
Direktorin Klinik für Pädiatrie m.S. Onkologie und Hämatologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Mitglieder

Prof. Dr. Frank Heppner
Direktor Institut für Neuropathologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Norbert Hübner
Gruppenleiter "Experimentelle Genetik von Herz- Kreislauferkrankungen"
MDC

Dr. Jan Philipp Junker
Gruppenleiter "Quantitative Entwicklungsbiologie"
MDC

Prof. Dr. Ulrich Keilholz
Direktor des Charité Comprehensive Cancer Center (CCCC)
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Ana Pombo
Gruppenleiterin "Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur"
MDC

Prof. Dr. med. Frank Tacke
Klinikdirektor der Medizinischen Klinik mit Schwerpunkt Hepatologie und Gastroenterologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin
 

BIH-CSCS-Pipeline Aufsichtsrat

(Berichterstattung an das Steuerungskomitee)

Vorsitz

Prof. Dr. Ulrich Keilholz
Direktor des Charité Comprehensive Cancer Center (CCCC)
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Mitglieder

Prof. Dr. Angelika Eggert
Direktorin Klinik für Pädiatrie m.S. Onkologie und Hämatologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Frank Heppner
Direktor Institut für Neuropathologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Ana Pombo
Gruppenleiterin "Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur"
MDC

Prof. Dr. Uwe Ohler
Gruppenleiter "Bioinformatik der Genregulation"
MDC

Single-Cell Tech leader (TBA)
MDC
 

Weiterführende Links und Informationen
 

Pressemitteilung Nr. 3 05. Februar 2020 Berlin

Neuer Forschungsbereich von BIH, MDC und Charité

• LifeTime-Initiative
• EINZELZELLANALYSE IN FORSCHUNG UND MEDIZIN Eine Stellungnahme der interdisziplinären Arbeitsgruppe Gentechnologiebericht. BERLIN-BRANDENBURGISCHE AKADEMIE DER WISSENSCHAFTEN
• "Jede einzelne Zelle im Blick" Helmholtz Interview Nikolaus Rajewsky
• Single Cell Omics Germany