DNA Helix
© Gerd Altmann, Pixabay

Ludwig Lab

Stammzelldynamiken und Mitochondriale Genomik

Das Labor wird gemeinsam vom Berlin Institute of Health (BIH) und dem Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB) am Max-Delbrück-Centrum getragen. Wir pflegen enge Kooperationen mit mehreren klinischen und wissenschaftlichen Einrichtungen der Charité – Universitätsmedizin Berlin, an der Leif S. Ludwig eine Heisenberg-Professur innehat. Diese Zusammenarbeit fördert translationale und systemmedizinische Forschung an der Schnittstelle von Genetik, Immunologie, Hämatologie und menschlichen Erkrankungen.

Informationen zu unserer Arbeitsgruppe finden Sie auf der englischen Seite.

Team

Leiter

Prof. Dr. Dr. Leif S. Ludwig
Prof. Dr. Dr. Leif S. Ludwig
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.41
+49 30 9406 – 1429

Wissenschaftler

Dr. med. Simon Berhe
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49
Dr. rer. nat. Stephania Contreras Castillo
Dr. rer. nat. Stephania Contreras Castillo
Dr. rer. nat. Paul-Lennard Mendez
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49

Technischer Assistent

Janet Liebold
Janet Liebold
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49
+49 30 9406 – 1592

Doktorand

Marc Lucas Appis
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49
Kainaat Mumtaz
Kainaat Mumtaz
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49
Klara Penkert
Klara Penkert
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49
Maren Salla
Maren Salla
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49

Student

Niklas Otto Kotzian
Niklas Otto Kotzian
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.44−49

Teamassistenz

Juliane Großkopf
101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.01
+49 30 9406 – 1452
group of people

Group photo 2024

group of people

Group photo 2024

group photo

Group photo 2023

© Thomas Rafalzyk / Berlin Institute of Health
group of people

Group photo 2022

© Thomas Rafalzyk / Berlin Institute of Health

Veröffentlichungen

/ Aging Cell 

Cellular heterogeneity during arterial aging

  • He Xu
  • Paul-Lennard Mendez
  • Dimitri Kasakovski
  • Judith Sluimer
/ Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology 

Coordinated IFN‑γ/​TNF axis drives selective loss of activated enteric glia in inflammatory bowel diseases

  • Marvin Bubeck
  • Klara A. Penkert
  • Heidi Limberger
  • Miguel González Acera
  • Christina Plattner
  • Svenja Ziegler
  • Anoohya Muppirala
  • Patrycja Forster
  • Manuel Jakob
  • Reyes Gamez-Belmonte
  • Lena Erkert
  • Subhash Kulkarni
  • Claudia Günther
  • Raja Atreya
  • Anja A. Kühl
  • Ahmed N. Hegazy
  • Kai Hildner
  • Zlatko Trajanoski
  • Britta Siegmund
  • Markus F. Neurath
  • Meenakshi Rao
  • Fränze Progatzky
  • Dieter Chichung Lie
  • Christoph Becker
  • Chiara Romagnani
  • Leif S. Ludwig
  • Christoph S.N. Klose
  • Jay V. Patankar
/ Genome Medicine 

circVDJ-seq for T cell clonotype detection in single-cell and spatial multi-omics

  • Izabela Plumbom
  • Benedikt Obermayer
  • Raphael Raspe
  • Anna Pascual-Reguant
  • Ilan Theurillat
  • Tancredi Massimo Pentimalli
  • Yu-Hsin Hsieh
  • Marine Gil
  • Carola Dietrich
  • Michaela Seeger-Zografakis
  • Claudia Quedenau
  • Jeannine Wilde
  • Caroline Braeuning
  • Cornelius Fischer
  • Markus Schuelke
  • Volkhard Seitz
  • Leif S. Ludwig
  • Angelika Eggert
  • Nikolaus Rajewsky
  • Tatiana Borodina
  • Dieter Beule
  • Janine Altmueller
  • Helena Radbruch
  • Anja Erika Hauser
  • Thomas Conrad
/ Gastroenterology 

IBDome: an integrated molecular, histopathological, and clinical atlas of inflammatory bowel diseases

  • Christina Plattner
  • Gregor Sturm
  • Anja A. Kühl
  • Raja Atreya
  • Sandro Carollo
  • Dietmar Rieder
  • Raphael Gronauer
  • Michael Günther
  • Steffen Ormanns
  • Claudia Manzl
  • Stefan Wirtz
  • Asier Rabasco Meneghetti
  • Ahmed N. Hegazy
  • Jay V. Patankar
  • Zunamys I. Carrero
  • Felix Grabherr
  • Moritz Meyer
  • Timon E. Adolph
  • Herbert Tilg
  • Markus F. Neurath
  • Jakob Nikolas Kather
  • Christoph Becker
  • Britta Siegmund
  • Zlatko Trajanoski
/ Cancer Cell 

Clonal lineage tracing of innate immune cells in human cancer

  • Vincent Liu
  • Katalin Sandor
  • Patrick K. Yan
  • Zhuang Miao
  • Yajie Yin
  • Robert R. Stickels
  • Andy Y. Chen
  • Kamir Hiam-Galvez
  • Jacob Gutierrez
  • Wenxi Zhang
  • Sairaj M. Sajjath
  • Raeline Valbuena
  • Steven Wang
  • Bence Daniel
  • Leif S. Ludwig
  • Brooke E. Howitt
  • Caleb A. Lareau
  • Ansuman T. Satpathy
/ Genome Biology 

Single-cell epigenetic and transcriptomic states across the continuum of monoclonal B cell lymphocytosis to chronic lymphocytic leukemia

  • Anja C. Rathgeber
  • Stacey M. Fernandes
  • Adi Nagler
  • Shuqiang Li
  • David M. Dorfman
  • Lars Bullinger
  • Matthew S. Davids
  • Jennifer R. Brown
  • Kenneth J. Livak
  • Leif S. Ludwig
  • Catherine J. Wu
  • Livius Penter
/ Cancer Medicine 

Deep learning-based analysis of gene expression data and gene-related information in pediatric surgical oncology: a scoping review

  • Simon Berhe
  • Steffen E. Fuchs
  • Altuna Akalin
  • Alida F.W. van der Steeg
  • Steven W. Warmann
  • Myrthe A.D. Buser
  • Moritz Markel
/ Cardiovascular Research 

Integrated left ventricular multi-omics landscape of human cardiometabolic HFpEF

  • Federico Capone
  • Karl-Philipp Rommel
  • Martin Forbes
  • Pauline Fahjen
  • Stefano Strocchi
  • Sebastian Rosch
  • Rongling Wang
  • David Bode
  • Natasha Nambiar
  • Tolga Eroglu
  • Leandro Santiago-Padilla
  • Mario Luca Morieri
  • Luo Liu
  • Catherine Farrelly
  • Antonio Vacca
  • Guido Mastrobuoni
  • Simone Jung
  • Saskia A. Diezel
  • Sarah V. Liévano Contreras
  • Norbert Hübner
  • Philipp Mertins
  • Stefan Kempa
  • Philipp Lurz
  • Gabriele G. Schiattarella
/ Cellular and molecular gastroenterology and hepatology 

Early gut-vascular barrier breakdown precedes colitis onset in murine models

  • Mariam Mohamed Abdou
  • Lucas Kreiß
  • Benjamin Schmid
  • Oana-Maria Thoma
  • René Krüger
  • Alan Bénard
  • Tanja M. Müller
  • Annkathrin Knauss
  • Michael Gabel
  • Miguel González-Acera
  • Yanmin Lyu
  • Katja Petter
  • Aylin Lindemann
  • Mina Saad Aziz Saad
  • Philip Eichhorn
  • Christoph Becker
  • Elisabeth Naschberger
  • Sebastian Zundler
  • Benno Weigmann
  • Timo Rath
  • Raja Atreya
  • Anja A. Kühl
  • Zlatko Trajanoski
  • Oliver Friedrich
  • Maximilian J. Waldner
  • Markus F. Neurath
  • Martin Herrmann
  • Sebastian Schürmann
  • Nathalie Britzen-Laurent
  • Michael Stürzl
/ Nature Communications 

Single-cell multi-omic analysis of mitochondrial mutational mosaicism and dynamics

  • Yu-Hsin Hsieh
  • Pauline Kautz
  • Lena Nitsch
  • Ambre M. Giguelay
  • Janet Liebold
  • Veronika Dimitrova
  • Stephania Contreras Castillo
  • Freya Jungen
  • Gabor Zsurka
  • Genevieve Trombly
  • Markus Schuelke
  • Wolfram S. Kunz
  • Caleb A. Lareau
  • Leif S. Ludwig

Nachrichten

Dr. Sakshi Shambhavi and Dr. Jorge Martínez-Cano
Wissenschaft 

Unsere ersten ​„Global Fellow“-Postdocs

Mit dem ​„Global Fellow Postdoctoral Program“ möchte das Max Delbrück Center die interdisziplinäre Zusammenarbeit verschiedener Arbeitsgruppen fördern. Die ersten Stipendiat*innen des dreijährigen Programms, die gleichzeitig in mehreren Teams des Zentrums forschen werden, fangen diesen Monat bei uns an. 
Ludwig Leif
Wissenschaft 

Professur für Leif Si-Hun Ludwig

Leif Si-Hun Ludwig erhält eine Heisenberg-Professur für Stammzelldynamiken und Mitochondriale Genomik am Berlin Institute of Health at Charité (BIH). Die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) fördert die prestigeträchtige Position. 
Mädchen in einem Labor
Wissenschaft 

Bioinformatik? Na klar!

Wie geht eigentlich Forschung? Was machen Datenwissenschaftlerinnen und was ein Tierpfleger? Zum Girls‘ Day waren in diesem Jahr 17 Mädchen am Max Delbrück Center zu Gast – und fünf Jungen zum Boys‘ Day. 
Headerbild von Lena Nitsch am BIMSB.
Institut & Campus 

„In New York habe ich Selbstvertrauen gewonnen“

Arbeiten in Berlin Mitte und New York – Lena Nitsch forscht sowohl am MDC-BIMSB als auch an der New York University. Für ​„Wir am MDC“ erzählt die Doktorandin, wie sie in zwei Laboren arbeitet, über ihre Erfahrungen in den USA und was sie durch das ​„MDC-NYU PhD Exchange Program“ gelernt hat. 
Leif Ludwig
Institut & Campus 

Leif Ludwig wird EMBO Young Investigator

Die Wissenschaftsorganisation ​„European Molecular Biology Organization“ (EMBO) hat Leif S. Ludwig vom Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) und Max Delbrück Center in ihr ​„Young Investigator Programme“ aufgenommen. Das Netzwerk fördert exzellente junge Wissenschaftler*innen.
cow cells taken with a microscope. the mitochondria were stained in bright yellow to visualize them in the cell. The large blue dots are the cell nuclei and the gray web is the cytoskeleton of the cells.
Pressemitteilung Nr. 26  Berlin 

T‑Zellen brauchen gesunde Zellkraftwerke

Einige T‑Zellen des Immunsystems reagieren besonders empfindlich auf krankmachende Fehler im Erbgut von Mitochondrien, den Kraftwerken der Zelle. Ihre Ergebnisse veröffentlichen Forschende am BIH und Max Delbrück Center nun in der Zeitschrift ​„Nature Genetics“. 
Leif Ludwig im Labor
Pressemitteilung Nr. 25  Berlin 

Heinz Maier-Leibnitz-Preis für Leif S. Ludwig

Der Biochemiker und Arzt Leif S. Ludwig vom Berlin Institute of Health in der Charité (BIH) und Max Delbrück Center erhält den Heinz Maier-Leibnitz-Preis 2023. Das gab die Deutsche Forschungsgemeinschaft DFG am 27. Juni bekannt. 
Wissenschaftliches Bild
Wissenschaft 

Krebs bei Kindern Zelle für Zelle analysieren

Das Neuroblastom ist die dritthäufigste bösartige Krebserkrankung bei Kindern. Um Therapiechancen zu verbessern, untersuchen 16 AGs am Max Delbrück Center und weitere Berliner Forschende nun in einem neuen Sonderforschungsbereich, wie der Krebs entsteht und wächst. Die DFG fördert das Vorhaben mit rund 13,5 Millionen Euro. 
Portrait
Pressemitteilung Nr. 2  Berlin 

Paul Ehrlich-Stiftung zeichnet Leif Ludwig aus

Für seine Analysemethode zur Neubildung von Blutzellen erhält Leif S. Ludwig, Forscher am Max Delbrück Center und am Berlin Institute of Health in der Charité (BIH), den Paul Ehrlich- und Ludwig Darmstaedter-Nachwuchspreis 2023. Das gab der Stiftungsrat der Paul Ehrlich-Stiftung heute bekannt. 
miniature chips
Pressemitteilung Nr. 37  Berlin 

Viermal so viele Informationen pro Zelle

Forscher*innen des BIH in der Charité, des MDC sowie aus den USA und Japan haben die Analyse von Einzelzellen auf eine neue Stufe der Präzision gehoben: Sie kombinierten Methoden, die mRNA, strukturelle Zugänglichkeit der DNA, Proteine sowie Mutationen in mitochondrialer DNA bestimmen, schreiben sie in ​„Nature Biotechnology“. 

Forschungsthemen