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AG Grosswendt

Vom Zellzustand zur Funktion

Profil

Sowohl in normalen embryonalen Geweben als auch in Tumoren interagieren und kommunizieren Zellen miteinander, was ihre Genexpression und damit ihre Funktion beeinflusst. Um herauszufinden, wie diese Expressionsprogramme definiert sind, müssen wir den multizellulären Kontext berücksichtigen, in dem sie auftreten. Einzelzell-Sequenziertechnologien haben eine enorme Vielfalt von "Zellzuständen" offenbart, in denen Zellen, die normalerweise als derselbe Typ gelten, deutliche Unterschiede in ihrem Transkriptionsprofil aufweisen. Um herauszufinden, welche Zellzustände sich gegenseitig beeinflussen, entwickeln wir Strategien zur Analyse von Zellen in ihrem Gewebekontext und zur Identifizierung der Kommunikationsereignisse, die für bestimmte zelluläre Entscheidungen und Verhaltensweisen verantwortlich sind. Durch die Erweiterung des Potenzials von Einzelzellansätzen zielt unser Team aus Experimentatoren und Computerwissenschaftlern darauf ab, die enge Beziehung zwischen Zellidentität und Gewebeorganisation zu entschlüsseln.

Eine zentrale Herausforderung für die Zukunft besteht darin, zu verstehen, wie Zell-Zell-Interaktionen abnormales Gewebewachstum und -organisation beeinflussen. Einige Tumore scheinen beispielsweise normale Entwicklungsprogramme zu nutzen, so dass sie sich ohne zusätzliche Mutationen weiter verändern können. Tatsächlich ähneln Tumorzellen von Krebsarten wie Neuroblastom und Melanom Zellen, die normalerweise nur während der pränatalen Entwicklung vorkommen. Wir wollen besser verstehen, wie diese embryonalen Genexpressionsprofile während der normalen Entwicklung geformt werden und warum solche ähnlichen Zustände in Tumorzellen zu beobachten sind. Unser besonderes Interesse gilt der biomedizinisch relevanten Neuralleiste des sich entwickelnden Embryos, aus der Tumoren entstehen können, die eine erhebliche zelluläre Heterogenität und Plastizität aufweisen. Zu verstehen, wie Zellen miteinander interagieren und diese embryonalen Programme ausführen, wird von unschätzbarem Wert sein, um die Erkennung der Heterogenität von Tumorzellen zu verbessern und wirksamere Behandlungen zu entwickeln.

Unsere Gruppe ist Teil des gemeinsamen Forschungsschwerpunkts "Einzelzellansätze für die personalisierte Medizin" des Berlin Institute of Health (BIH) der Charité und des Max-Delbrück-Centrums für Molekulare Medizin (MDC) und wir arbeiten eng mit der klinischen Abteilung für Pädiatrische Onkologie und Hämatologie der Charité zusammen. Unser Labor ist am Berliner Institut für Medizinische Systembiologie (BIMSB) des MDC angesiedelt.

Team

AG Grosswendt: Tobias Christaller (links), Philipp Stachel-Braum (mittig), Stefanie Grosswendt (rechts)

Gruppenleiterin

Stefanie Grosswendt

101: Berlin Institute for Medical System Biology
Raum: 5.42
stefanie.grosswendt@mdc-berlin.de
+49 30 94061427-1427

 

PhD Studierende

Tobias Christaller

101: Berlin Institute of Medical Systems Biology
Raum: 5.44-49
Tobias.Christaller@mdc-berlin.de
+49 30 9406-1417

Philipp Stachel-Braum

MDC-NYU Fellowship
101: Berlin Institute of Medical Systems Biology
Raum: 5.44-49
Philipp.Stachel-Braum@mdc-berlin.de
+49 30 9406-1417

 

Master Studierende

Bárbara Zita Peters Couto

101: Berlin Institute of Medical Systems Biology
Raum: 5.44-49
barbarazita.peterscouto@mdc-berlin.de

+49 30 9406-1595

 

Labormanagerin

Maria Will

101: Berlin Institute of Medical Systems Biology
Raum: 5.44-49
Maria.Will@mdc-berlin.de
+49 30 9406-1595

 

Teamassistenz 

Juliane Großkopf
101: Berlin Institute of Medical Systems Biology
Raum: 4.01
Juliane.Grosskopf@mdc-berlin.de
+49 30 9406-1452

Veröffentlichungen

Nachrichten

Jobs

Wir stellen ein:

Bewerber*innen, die an einer Postdoc- oder Doktorandenstelle interessiert sind, wenden sich bitte an Stefanie Grosswendt. Bitte fügen Sie Ihren Lebenslauf mit den Namen von mindestens zwei Empfehlungsgebern sowie ein Motivationsschreiben mit Ihrem Forschungsinteresse bei. Wir freuen uns besonders über Bewerbungen von Informatiker*innen für PhD- und Postdoc-Stellen. Computational PhD-Kandidat*innen würden von Laleh Haghverdi mitbetreut werden und können am CompCancer-Programm teilnehmen, mit dem unsere Gruppe verbunden ist.