Kydrashev Lab Header

AG Kudryashev

In Situ Structural Biology

Informationen zu unserer Arbeitsgruppe finden Sie auf der englischen Seite.

Team

Leiter

Prof. Dr. Mikhail Kudryashev
Prof. Dr. Mikhail Kudryashev
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0207

Wissenschaftler

Dr. Igor Maciel Souza Silva
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0209

Sekretariat

Jeannine Engel
+49 30 9406 – 2337

Technischer Assistent

Sabrina Golusik
Sabrina Golusik
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0284
+49 30 9406 – 3687

Doktorand

Xiaofeng Chu
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0206
Uljana Kravcenko
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0206
+49 30 9406 – 2260
Daniel Leopoldus
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0209
Artsemi Yushkevich
31.2: Max-Delbrück-Haus
Raum: 0208
Gruppenbild der AG Kudryashev

Retreat in Palermo, Italien im September 2022. Von links nach rechts, stehend: Artsemi Yushkevich, Ulja Kravcenko, Misha Kudryashev, Viachaslav Kralin; Vasilii Mikirtumov, Julia Ruta, Xiaofeng Chu, Sabrina Golusik. Untere Reihe: Dr. Giulia Glorani, Shutian Wang, Rui Li

Veröffentlichungen

/ Science Advances 

Phospholipid-driven conformational switching of HCV NS5A links protein folding to replication membrane remodeling

  • Anna V. Bulankina
  • Rebecca M. Richter
  • James H. Nettles
  • Daisuke Yamane
  • Christian Grimm
  • Yasaman Karami
  • Richard A. Stanton
  • Bianca Introini
  • Jonas Hermann
  • Hanaa Charif
  • Mia S. König
  • Claudia Stroß
  • Cristina Ortiz
  • Nico Kraus
  • Daniel Wood
  • Facundo Galceran
  • Rupert Abele
  • Bernard Maigret
  • Raymond F. Schinazi
  • Stefan Zeuzem
  • Ricardo M. Biondi
  • MinKyung Yi
  • Robert Tampé
  • Mikhail Kudryashev
  • Christoph Welsch
/ arXiv 

Cryo-SWAN: the Multi-Scale Wavelet-decomposition-inspired Autoencoder Network for molecular density representation of molecular volumes

  • Rui Li
  • Artsemi Yushkevich
  • Mikhail Kudryashev
  • Artur Yakimovich
/ Communications Engineering 

DeBCR: a sparsity-efficient framework for image enhancement through a deep-learning-based solution to inverse problems

  • Rui Li
  • Artsemi Yushkevich
  • Xiaofeng Chu
  • Mikhail Kudryashev
  • Artur Yakimovich
/ Nature Communications 

Dynamic nanoscale architecture of synaptic vesicle fusion in mouse hippocampal neurons

  • Jana Kroll
  • Uljana Kravčenko
  • Mohsen Sadeghi
  • Christoph A. Diebolder
  • Lia Ivanov
  • Małgorzata Lubas
  • Thiemo Sprink
  • Magdalena Schacherl
  • Mikhail Kudryashev
  • Christian Rosenmund
/ bioRxiv 

Cryo-EM structure of the naked mole-rat ribosome reveals a stabilized split 28S rRNA

  • Mehmet Gül
  • Alice Rossi
  • Christian M.T. Spahn
  • Gary R. Lewin
  • Mikhail Kudryashev
/ Turkish Journal of Biology 

Insights into therapeutic discovery through the Kelch domain structure of Keap1 at ambient temperature

  • M. Yilmaz
  • B. Sever
  • Y. Kutlu
  • M. Gül
  • C. Okuducu
  • S. Tavli
  • M. Otsuka
  • M. Fujita
  • T. Haliloğlu
  • H. Çiftçi
  • H. Demirci
/ bioRxiv 

Integrative structural interactomics reveals protein organization and structure in a giant virus

  • L. Mühlberg
  • J. Ruta
  • V. Mikirtumov
  • R. Burton-Smith
  • K. Murata
  • M. Kudryashev
  • K. Okamoto
  • B. Bogdanow
  • F. Liu
/ bioRxiv 

Structures of EHD2 filaments on curved membranes provide a model for caveolar neck stabilization

  • E. Vázquez-Sarandeses
  • V. Mikirtumov
  • J.K. Noël
  • M. Kudryashev
  • O. Daumke
/ Research Square 

Structural basis for membrane targeting and secretion of legionella SidE ubiquitin ligases

  • Mohit Misra
  • Rukmini Mukherjee
  • Anshu Bhattacharya
  • Tsai-Hsuan Weng
  • Chuang Li
  • Wenbo Chen
  • Larissa van Ek
  • Ahmed Mohammed
  • Alberto Cristiani
  • Yaobin Liu
  • Julia Pomirska
  • Adela Vidov
  • Diana Grewe
  • Gerbrand van der Heden van Noort
  • Gerhard Hummer
  • Anne-Claude Gavin
  • Schara Safarian
  • Zhao-Qing Luo
  • Ramachandra Bhaskara
  • Dmitri Svergun
  • Misha Kudryashev
  • Ivan Dikic
/ Journal of Peptide Science 

Penta-ALFA-tagged substrates for self-labelling tags allow signal enhancement in microscopy

  • S. Ghosh
  • R. Birke
  • A.K. Natarajan
  • J. Broichhagen

Nachrichten

wissenschaftliches Bild
Wissenschaft 

Neuer Bioengineering-Fokus am Max Delbrück Center

Mit zwei von Helmholtz geförderten Projekten baut das Max Delbrück Center einen neuen Schwerpunkt aus: das Biomedical Engineering. Die Kombination von Biomedizin, Ingenieurwissenschaft und künstlicher Intelligenz ermöglicht, Ergebnisse aus der Grundlagenforschung schneller in Therapien zu überführen. 
Igor Maciel Souza Silva
Wissenschaft 

Marie-Curie-Stipendium für Igor Maciel Souza Silva

Igor Maciel Souza Silva ist für ein zweijähriges Marie-Curie-Stipendium ausgewählt worden. Er möchte 3D-Strukturen des Rezeptors für den epidermalen Wachstumsfaktor ermitteln, der an der Entstehung von Tumoren beteiligt ist. Souza Silva hofft, dass seine Forschung Krebstherapien schonender macht. 
Wissenschaftliches Gerät
Pressemitteilung Nr. 34  Berlin 

Synaptische Bläschen in 3D abbilden

Wie genau sieht die molekulare Struktur synaptischer Bläschen aus, die Botenstoffe im Gehirn transportieren? Mithilfe der Kryo-Elektronentomographie haben Forschende am Max Delbrück Center neue Details aufgeklärt. Die Studie in ​„PNAS“ könnte Therapien für psychiatrische Erkrankungen beeinflussen. 
scientific image
Pressemitteilung Nr. 27  Berlin 

Neue Zielstruktur für Wirkstoffe in der Psychiatrie

Das Team um Misha Kudryashev am Max Delbrück Center hat ein molekulares Zwischenprodukt eines Serotoninrezeptors identifiziert. Es ist an Krankheiten wie Depressionen und Schizophrenie beteiligt und könnte ein Hinweis auf neue Therapieansätze sein, schreiben die Forscher*innen im ​„EMBO Journal“. 
Chrysanthi-Maria Moysidou, Ivan Ezquerra Romano and Ashwin Karthick Natarajan
Wissenschaft 

Unsere neuesten Marie-Curie-Stipendiat*innen

Drei Postdocs am Max Delbrück Center haben Marie-Skłodowska-Curie- Stipendien in Höhe von je 174.000 Euro gewonnen. Sie untersuchen, wie wir Nässe wahrnehmen, wie die Struktur eines mitochondrialen Proteins aussieht und wie man Bioelektronik in neuromuskuläre Organoide integrieren kann. 
wissenschaftliches Bild
Pressemitteilung Nr. 3  Berlin 

Wie ein Protein Bakterien bekämpft

Die Details vieler Prozesse der Immunabwehr sind noch unbekannt. Wie genau GBP1-Proteine Bakterien einkapseln, um sie so außer Gefecht zu setzen, beschreiben Forschende um Oliver Daumke und Misha Kudryashev vom Max Delbrück Center nun im Fachblatt ​„The EMBO Journal“. 
Dr. Misha Kudryashev
Wissenschaft 

W2-Professur für Mikhail Kudryashev

Die intensive Auseinandersetzung mit der Struktur von Proteinen, den Bausteinen des Lebens, bestimmt die wissenschaftliche Laufbahn von Mikhail Kudryashev. Zum 1. August 2022 wurde er nun auf eine Heisenberg-Professur an der Charité berufen. 
Dr. Misha Kudryashev
Wissenschaft 

📺 Wie ein Taucher in der Tiefsee

Strukturbiologen nutzen modernste Technologien wie die Kryo-Elektronenmikroskopie, um Einblicke in die Architektur von Molekülen zu gewinnen. Am MDC nimmt nun eine Strukturbiologie-Forschungsgruppe ihre Arbeit auf: Ihr Leiter Misha Kudryashev hat sich den Membranproteinkomplexen verschrieben. 

Forschungsthemen