Nervenzellen, aus Stammzellen der Maus gezüchtet

Single Cell Technologien für die personalisierte Medizin

Fokusbereich mit dem Berlin Institut für Gesundheitsforschung (BIH)

Single Cell Technologien für personalisierte Medizin sind ein Forschungsfokus von Berlin Institute of Health (BIH), Charité – Universitätsmedizin Berlin und Max-Delbrück-Centrum. Nikolaus Rajewsky (MDC) koordiniert gemeinsam mit Angelika Eggert (Charité) den Fokusbereich. Die Einzelzellanalyse ist auch Grundlage für das pan-europäische LifeTime-Konsortium: „Life Time: Revolutionizing Healthcare by Tracking and Understanding Human Cells during Disease“.

Um die hoch-innovativen Einzelzelltechnologien so rasch wie möglich für eine effektive Translation klinisch nutzbar zu machen, begründet das BIH eine gemeinsam getragene, enge interdisziplinäre Kooperation, in welche BIH und Charité kliniknahe Expertisen (Bioinformatik, Bildgebung, Maschinelles Lernen, Onkologie, Neurologie, Dermatologie, Biobanken, Diagnostik und Biomarker) und das MDC-Mitte (BIMSB) technologische und wissenschaftliche Expertise auf dem Gebiet der Einzelzellbiologie und Genregulation einbringen.

Die Umsetzung stützt sich auf zwei Säulen:

Die Etablierung von vier Brücken-Nachwuchsgruppen von BIH, MDC-Mitte (BIMSB) und Charité, welche Einzelzellexpertise in die klinische Anwendung bringen. Diese Nachwuchsgruppen werden im BIMSB-Gebäude angesiedelt, haben dort Zugang zu den neuesten Single Cell Technologien und stehen im engen Austausch mit international führenden Wissenschaftler*innen. Gleichzeitig sind diese Gruppen in jeweils eine Klinik in der Charité integriert, mit der sie klinisch relevante Themen identifizieren, Single Cell Ansätze nutzen und entwickeln, um konkrete klinische Fragestellungen zu bearbeiten und die Technologien für die klinische Nutzung zu etablieren. Dieses Brückenkonzept verknüpft in optimaler Weise die international führende Position des BIMSB in der Entwicklung von Single Cell Technologien mit dem klinisch-translationalen Potential von BIH/Charité.

Den Aufbau einer „Clinical Single Cell Sequencing“ Pipeline, welche ein zentrales Bioportal (Patientenprobengewinnung, -charakterisierung und -verarbeitung) sowie einen integrierten Workflow mit relevanten Genomik- und Bioinformatik-Services für die teilnehmenden Kliniken beinhaltet.
 

Steuerungskomitee

 

Sprecher


Stellvertretende Sprecherin

Prof. Dr. Angelika Eggert
Direktorin Klinik für Pädiatrie m.S. Onkologie und Hämatologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin


Mitglieder

Prof. Dr. Frank Heppner
Direktor Institut für Neuropathologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Norbert Hübner
Gruppenleiter "Experimentelle Genetik von Herz- Kreislauferkrankungen"
MDC

Dr. Jan Philipp Junker
Gruppenleiter "Quantitative Entwicklungsbiologie"
MDC

Prof. Dr. Ulrich Keilholz
Direktor des Charité Comprehensive Cancer Center (CCCC)
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Ana Pombo
Gruppenleiterin "Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur"
MDC

Prof. Dr. med. Frank Tacke
Klinikdirektor der Medizinischen Klinik mit Schwerpunkt Hepatologie und Gastroenterologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin
 

BIH-CSCS-Pipeline Aufsichtsrat

(Berichterstattung an das Steuerungskomitee)

Vorsitz

Prof. Dr. Ulrich Keilholz
Direktor des Charité Comprehensive Cancer Center (CCCC)
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Mitglieder

Prof. Dr. Angelika Eggert
Direktorin Klinik für Pädiatrie m.S. Onkologie und Hämatologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Frank Heppner
Direktor Institut für Neuropathologie
Charité – Universitätsmedizin Berlin

Prof. Dr. Ana Pombo
Gruppenleiterin "Epigenetische Regulation und Chromatinstruktur"
MDC

Prof. Dr. Uwe Ohler
Gruppenleiter "Bioinformatik der Genregulation"
MDC

Single-Cell Tech leader (TBA)
MDC
 

 

Weiterführende Links und Informationen
 

 

Bild: Alessandra Zappulo / Marina Chekulaeva Lab, MDC

 

Kontakt

Rukeia El-Athman
Koordinatorin Forschungsschwerpunkte
Telefon: +49 30 450 543 314
E-Mail: rukeia.el-athman@bihealth.de

Dr. Chiara Baccin
Single Cell Project Manager
Berlin Institute for Medical Systems Biology (BIMSB)
Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin (MDC)
Hannoversche Str. 28 | 10115 | Berlin
E-mail: chiara.baccin@mdc-berlin.de
Tel.: +49 (0)30 9406 1380