Räumliche Transkriptomik

Mit mehr als zwei Millionen Euro fördert der britische Wellcome Trust ein Forschungsprojekt, das untersucht, wie sich Malaria auf die Entwicklung Ungeborener auswirkt. Emanuel Wyler vom Max Delbrück Center erforscht dabei die Wechselwirkungen zwischen dem Parasiten Plasmodium falciparum und der Plazenta.

Der European Research Council fördert Markus Mittnenzweig mit 1,5 Millionen Euro. Er und sein Team am Max Delbrück Center arbeiten an dynamischen 3D-Modellen: Sie zeigen, wie Genaktivität und benachbarte Zellen embryonale Zebrafischzellen dazu anleiten, sich zu spezialisierten Geweben zu entwickeln.

Wenn sich Embryonen entwickeln, greifen unzählige molekulare Mechanismen ineinander. Markus Mittnenzweig entwirft Computermodelle, um die komplexen Prozesse der Zelldifferenzierung und Gewebebildung auszuwerten – und vorherzusagen. Die Erkenntnisse könnten auch helfen, Krankheiten zu vermeiden.

Ein Team um Nikolaus Rajewsky vom Max Delbrück Center hat eine frei zugängliche Plattform entwickelt, die Gewebeproben von Patient*innen mit subzellulärer Präzision auswertet. Die molekularen Karten erlauben detaillierte Analysen und können die klinische Pathologie verbessern, heißt es in „Cell“.

Organoide helfen Forschenden, biologische Prozesse in Gesundheit und Krankheit zu verstehen. Wie sie sich zu komplexen Geweben organisieren, ist jedoch schwierig zu beeinflussen. Eine Gruppe um Nikolaus Rajewsky beschreibt nun in „Nature Methods“ eine neue Methode, mit der ihr das gelungen ist.

Britische und deutsche Forscher*innen haben den bisher detailliertesten Zellatlas des menschlichen Herzes erstellt. Wie sie in „Nature“ berichten, umfasst er erstmals die Zellen, in denen der Herzschlag entsteht. Die Daten sind unter anderem eine Referenz für Studien zu Herzrhythmusstörungen.

Damit Einzelzelltechnologien und Systemmedizin in der Klinik ankommen können, veranstalteten MDC, BIH und Charité die erste e:Med Single Cell Summer School. 20 internationale Doktorand*innen aus Biologie, Medizin und Datenwissenschaft kamen in Berlin zusammen, um sich auszutauschen.

Wie kann ein Herz sich selbst heilen? Und wie entscheidet sich, welches Geschlecht ein Lebewesen hat? Der Europäische Forschungsrat ERC zeichnet Dr. Jan Philipp Junker und Dr. Darío Lupiáñez mit Consolidator Grants aus. Damit verbunden ist eine Förderung in Höhe von zwei Millionen Euro über fünf Jahre.

Räumlich aufgelöste Transkriptomik verändert die Art und Weise, wie wir komplexe Gewebe verstehen, schrieb „Nature Methods“, als das Journal die Technologie als „Methode des Jahres 2020“ auszeichnete. Ein virtueller SCOG-Workshop gab nun einen Überblick über die neuesten Entwicklungen auf dem Gebiet.

Aus der Genexpression von Einzelzellen können Algorithmen nicht nur deren Ursprungsort im Gewebe rekonstruieren, sondern auch funktionelle Details ablesen. Das berichten die Teams um Kai Schmidt-Ott und Nikolaus Rajewsky im Fachjournal „JASN“ am Beispiel der Niere.