GenomicsPlatform_Illumina_NovaSeq_FlowCells

Genomics Technology Platform

Janine Altmüller

Informationen zu unserer Technologieplattform finden Sie auf der englischen Seite.

Team

Die BIH/MDC Genomics Technology Platform, unter der Leitung von Janine Altmüller, umfasst vier Teams: Next Generation Sequencing, Single-Cell Technologie, Flow Cytometry und Data Management, unter der Leitung von Tatiana Borodina, Thomas Conrad, Caroline Braeuning und Marten Jäger.

Bastian Salewsky
bastian.​salewsky@​bih-​charite.​de
+49 30 450 643 364 
RHC lab
PacBio and Oxford Nanopore sequencing | NGS library preparation | Nucleic acids isolation

Bella Hamid
bella.hamid@mdc-berlin.de 
MDC lab
Flow Cytometry

Carola Dietrich
carola.​dietrich@​mdc-​berlin.​de 
+49 30 9406 1342
MDC lab
Single-cell genomics

Caroline Braeuning
caroline.​braeuning@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 – 3043
MDC lab
Team leader Flow Cytometry

Catrin Janetzki
catrin.​janetzki@​bih-​charite.​de
+49 30 450 643 366  
RHC lab
NGS library preparation | Illumina sequencing

Claudia Quedenau
quedenau@​mdc-​berlin.​de
+49 30 450 643 364 
RHC lab
Safety and first aid | PacBio and Oxford Nanopore sequencing | NGS library preparation

Cornelia Schlee
cornelia.​schlee@​bih-​charite.​de
+49 30 450 643 366
RHC lab
NGS library preparation | Illumina sequencing

Cornelius Fischer
cornelius.​fischer@​bih-​charite.​de 
+49 30 450 569 048
RHC
Data management

Elisabeth Kirst
elisabeth.​kirst@​charite.​de
+49 30 450 643 365 
RHC lab
NGS library preparation | Illumina sequencing

Helene Pflugk
helene.pflugk@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 1357
MDC lab
Flow cytometry support

Isabell Becker
isabell.becker@mdc-berlin.de
+49 30 450 676 272
RHC lab
NGS library preparation | Illumina sequencing

Izabela Plumbom
izabela.​plumbom@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 1320
MDC lab
Single-cell genomics | Spatial transcriptomics

Jakob Hilgenfeld
jakobhannes.hilgenfeld@mdc-berlin.de
+49 30 9406 3266
MDC lab
student assistent

Janine Altmüller
janine.​altmueller@​mdc-​berlin.​de
janine.​altmueller@​bih-​charite.​de
+49 30 9406 1434
+49 30 450 643 363 

Head of BIH/MDC Genomics Technology Platform

Jeannine Wilde
jeannine.​wilde@​mdc-​berlin.​de
+49 30 450 643 368 
RHC lab
Illumina sequencing coordination | NGS library preparation

Kirsten Richter
kirsten.​richter@​mdc-​berlin.​de
Lab administration

Lorena Derezanin
lorena.​derezanin@​bih-​charite.​de
+49 30 450 669 048
RHC
Data management

Madlen Sohn
madlen.​sohn@​mdc-​berlin.​de
+49 30 450 643 365 
RHC lab
NGS library preparation | Illumina sequencing

Marko Vukovic
marko.​vukovic@​mdc-​berlin.​de
MDC lab
Single-cell genomics

Marten Jäger
marten.​jaeger@​bih-​charite.​de
+49 30 450 569 048
RHC
Team leader Data management

Michaela Seeger-Zografakis
mseeger@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 1324
MDC lab
Flow Cytometry support 

Namuun Battur
namuun.​battur@​bih-​charite.​de 
+49 30 450 669 048
RHC lab
Data Management 

Olivia Hochleitner
olivia.​hochleitner@​mdc-​berlin.​de
MDC lab
single cell genomics / spatial transcriptomics 

Sarah Vitcetz
sarah.​vitcetz@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 3041
MDC lab
Lab management / single cell genomics / spatial transcriptomics 

Tatiana Borodina
tatiana.​borodina@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 1341 
+49 30 450 643 367 
MDC / RHC
Team leader Next Generation Sequencing 

Thomas Conrad
thomas.​conrad@​mdc-​berlin.​de
+49 30 9406 1481
MDC
Team leader Single-cell Technologies

Ulrike Krüger
ulrike.​krueger@​bih-​charite.​de
+49 30 450 643 507
RHC lab
Project coordination and Lab management | NGS library preparation | Illumina sequencing

Ute Ungethüm
ute.​ungethuem@​bih-​charite.​de
+49 30 450 676 272
RHC lab
Coordination of large-scale projects (Charité lab) | Automation of nucleid acid extraction and QC assays

Wassim Salam
wassim.​salam@​bih-​charite.​de
+49 30 450 669 048
RHC lab
Data management

Nachrichten

Abwasser aus Berlin im Labor
Pressemitteilung Nr. 22  Berlin 

Virale Artenvielfalt im Abwasser

Umfassende Metagenom-Sequenzierungen des Berliner Abwassers über 17 Monate zeigen, dass man so die Ausbreitung von Krankheitserregern überwachen und Ausbrüche vorhersagen kann. Wie das Team um Markus Landthaler in ​„Environmental International“ schreibt, haben sie zudem Tausende neuer Viren entdeckt. 
Behandschuhte Hand hält einen Datenchip zwischen Daumen und Zeigefinger.
Pressemitteilung Nr. 35  Berlin 

Nierenkrankheit genetisch entschlüsselt

Bartter-Syndrom Typ 3 geht auf mehrere Strukturvarianten im Genom zurück. Mithilfe der ​„Long-read-Sequenzierung“ konnte Janine Altmüller und ihr Team vom Max Delbrück Center, BIH und der Uniklinik Köln die seltene Krankheit genauer analysieren. Die Ergebnisse stellen sie in ​„Genome Medicine“ vor. 
Genomics
Wissenschaft 

Großes Finale für europäisches Genomprojekt

Das von der EU mit rund zehn Millionen Euro finanzierte Projekt EASI-Genomics, das Forschenden den Zugang zu modernen Sequenzierungstechnologien erleichtern sollte, steht nach vier Jahren vor seinem Abschluss. Janine Altmüller, die Leiterin der Technologie-Plattform Genomik, zieht Bilanz. 
Nebennierenrinde
Institut & Campus 

Preis für Zellatlas der Nebenniere

Wie sich die Nebenniere selbst reguliert und wie dort Krebs entsteht, ist bislang weitgehend unbekannt. Für ihre Arbeiten an einem Zellatlas der Hormondrüse haben MDC-Doktorand Ali Kerim Secener und Barbara Altieri vom Uniklinikum Würzburg den 55. Schoeller-Junkmann-Preis erhalten. 
Laborantin filtert das Abwasser
Pressemitteilung Nr. 5  Berlin 

Neuer Omikron-Subtyp auf dem Vormarsch

Ähnlich wie zuvor in Dänemark breitet sich in Berlin ein weiterer Subtyp der Omikron-Variante aus: BA.2. Das ergab die Auswertung von Abwasserproben am MDC in Kooperation mit den Berliner Wasserbetrieben und dem Berliner Labor der amedes-Gruppe. Durch BA.2 könnte sich die derzeitige Corona-Welle verlängern. 
Janine Altmüller
Wissenschaft 

Janine Altmüller leitet die Genomik-Technologieplattform

Der genomischen Forschung in Berlin zu noch mehr Ansehen verhelfen – das ist das Ziel von Dr. Janine Altmüller. Seit dem 1. Juli leitet sie die gemeinsame Genomik-Technologieplattform von BIH und MDC, unterstützt Berliner Forscher*innen und feilt an neuen Methoden und Technologien. 
Aeon
Pressemitteilung Nr. 25  Berlin 

Vom Verstehen zum Verändern: Die Zukunft der Genomforschung

CRISPR inspiriert Forschung und Kunst – auf unterschiedliche Art. Auf der Berlin Science Week präsentiert das MDC das Ergebnis einer Artist Residency zu dem Thema und fragt: Wissen wir schon genug über das Genom, um solche Werkzeuge beim Menschen einzusetzen? 
Wissenschaft 

Mit Barcodes die Zellentwicklung verfolgen

Für manche Anwendungen – etwa in der Entwicklungsbiologie – darf das Erbgut bei der Entschlüsselung nicht erst in winzige Stücke zerhackt werden. Vielmehr sind lange Leselängen von mehreren Tausend Basen nötig. Ein aktuelles Nature-Paper zeigt, was mit dem PacBio-Sequenzierer der Genomics-Technologieplattform am MDC möglich ist. 
MINT-EC
Institut & Campus 

Bits, Bytes und Bakterien: Systembiologie-Woche am MDC

Lässt sich das Leben von Mikroorganismen mathematisch beschreiben? Um Fragen wie diese geht es bei der MINT-Excellence-Akademie ​„Systembiologie“, die vom 6. bis 10. Februar 2017 am MDC stattfindet. 20 Schülerinnen und Schüler aus ganz Deutschland lernen im Labor und am Rechner, wie Wissenschaftler biologische Vorgänge modellieren. 
Pressemitteilung Nr. 37  Berlin 

In Maßen genießen: Traubenfarbstoff schützt Zellen vor Alterung

Nahrungsergänzungsmittel mit Resveratrol, einem Farbstoff aus roten Weintrauben, erfreuen sich… 

Next Generation Sequenzierung

Informationen finden Sie auf der englischen Seite.

Dr. med. Janine Altmüller

Leitung

Dr. med. Janine Altmüller

Janine.Altmueller@mdc-berlin.de

+49 30 9406 1434

 

Next Generation Sequencing

Dr. Tatiana Borodina

Tatiana.Borodina@mdc-berlin.de

+49 30 9406 1341

 

Single-Cell Technologies

Dr. Thomas Conrad

Thomas.Conrad@mdc-berlin.de

+49 30 9406 1481

 

Flow Cytometry

Caroline Braeuning

Caroline.Braeuning@mdc-berlin.de

+49 30 9406 3043

 

Data Management

Dr. Marten Jäger

Marten.jaeger@bih-charite.de

+49 30 450 569 048

 

Sekretariat

Sabrina Deter

Sabrina.Deter@mdc-berlin.de

+49 30 9406 2920

 

 

Diese Technologie Plattform wird co-finanziert und ist integrierte Infrastruktur des Berlin Institute of Health (BIH).

BIH

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